144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1583 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 262 aa  501  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  32.26 
 
 		 312 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3646  formate/nitrate transporter  32.39 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3719  formate/nitrate transporter  32.39 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3659  formate/nitrate transporter  32.39 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.02842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1015  formate/nitrate transporter  33.33 
 
 		 275 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  27.87 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  25.2 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  32.26 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  25.1 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  25.49 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  25.29 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  31.35 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  24.21 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  24.21 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  24.21 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  24.21 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3500  formate/nitrite family of transporters-like protein  32.63 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.999349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  23.51 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  23.41 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  23.41 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  23.51 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  23.41 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  23.51 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  23.41 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  23.51 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  23.81 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  26.23 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  26.77 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  23.02 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  23.02 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  25.1 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  27.34 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  27.49 
 
 		 604 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  21.18 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  22.83 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  24.11 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15970  formate/nitrite transporter family protein  39.83 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  25.98 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  25 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1061  formate/nitrite transporter  29.65 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  22.71 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  30.53 
 
 		 732 aa  68.9  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  25 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  23.32 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  37.6 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  24.58 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  27.2 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  23.28 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  26.19 
 
 		 625 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  25.69 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  24.39 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  23.53 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  24.58 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  26.74 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  24.81 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  26.23 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  32.63 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  24.14 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  24.14 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  24.14 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  23.48 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  28.86 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  23.83 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  31.58 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  25.1 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  26.59 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  25.1 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  23.28 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  23.61 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  25.1 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  24.69 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  24.69 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  25.47 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  24.24 
 
 		 295 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  24.27 
 
 		 283 aa  52  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  24.1 
 
 		 277 aa  52  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  26.2 
 
 		 279 aa  52  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  24.27 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  26.59 
 
 		 361 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  26.59 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  24.9 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  24.69 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  27.24 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  23.81 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  27.31 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  28.18 
 
 		 288 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  22.55 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  23.18 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  24.28 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  22.18 
 
 		 483 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  27.91 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  23.37 
 
 		 537 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  24.9 
 
 		 323 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  26.46 
 
 		 508 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  25.69 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  22.6 
 
 		 483 aa  45.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  23.08 
 
 		 483 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  25.97 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2689  formate/nitrite transporter  27.54 
 
 		 330 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>