80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0404 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  588  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  44.26 
 
 
298 aa  225  8e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  44.15 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  35.79 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 
322 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  34.75 
 
 
279 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 
283 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  34.3 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 
276 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  34.11 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  32.55 
 
 
273 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  29.93 
 
 
277 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  30.99 
 
 
283 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  32.08 
 
 
269 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 
274 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  29.05 
 
 
275 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  29.66 
 
 
273 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  29.77 
 
 
280 aa  95.5  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  31.19 
 
 
271 aa  93.6  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  29.01 
 
 
274 aa  89.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  28.97 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 
623 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  28.14 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  30.03 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  27.84 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  27.84 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.32 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2941  nitrite/nitrate reduction protein  32.37 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  30.64 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  30.64 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  31.39 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  30.64 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  30.64 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1718  hypothetical protein  27.71 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2226  hypothetical protein  30.62 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  26.95 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2163  hypothetical protein  28.45 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.176689  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  30.6 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  27.19 
 
 
292 aa  62.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  28.31 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  24.22 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  31.56 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  23.34 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  28.65 
 
 
276 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  28.51 
 
 
276 aa  59.3  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  28.05 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  26.41 
 
 
272 aa  56.2  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  25.78 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  28.35 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  26.32 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  28.27 
 
 
275 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  26.73 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2164  hypothetical protein  24.78 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.707618  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  28.4 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  26.75 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  25.89 
 
 
274 aa  49.3  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.84 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  27.68 
 
 
272 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  30.97 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  29.63 
 
 
305 aa  46.2  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.67 
 
 
275 aa  45.8  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  29.1 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  33.58 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1043  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 
254 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  28.57 
 
 
275 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  33.04 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  27.01 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  25.15 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.93 
 
 
307 aa  43.1  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  26.2 
 
 
279 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  25.97 
 
 
276 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  35.14 
 
 
244 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>