More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05320 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_05320  Phytoene dehydrogenase N terminal region  100 
 
 		 270 aa  555  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.314131  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  49.43 
 
 		 511 aa  279  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  44.26 
 
 		 525 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  41.3 
 
 		 553 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  39.78 
 
 		 530 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  39.3 
 
 		 529 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  39.78 
 
 		 530 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  37.75 
 
 		 530 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  29.01 
 
 		 519 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  32.66 
 
 		 518 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  32.18 
 
 		 511 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  32.18 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  33.73 
 
 		 502 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  33.73 
 
 		 502 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  32.05 
 
 		 511 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  28.41 
 
 		 508 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  30.28 
 
 		 507 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  29.76 
 
 		 493 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  32.68 
 
 		 505 aa  153  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  30.3 
 
 		 507 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  31.23 
 
 		 531 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  31.42 
 
 		 504 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  30.83 
 
 		 511 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  29.59 
 
 		 504 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  31.45 
 
 		 511 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  29.07 
 
 		 502 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  28.99 
 
 		 524 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  26.46 
 
 		 508 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 504 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  29.55 
 
 		 492 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  28.69 
 
 		 508 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  30 
 
 		 491 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  32.38 
 
 		 518 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  32.38 
 
 		 518 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  29.32 
 
 		 492 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  32.07 
 
 		 497 aa  136  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  29.74 
 
 		 508 aa  136  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  25.6 
 
 		 508 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  29.57 
 
 		 497 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  28.4 
 
 		 506 aa  135  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  31.3 
 
 		 491 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  29.05 
 
 		 495 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  29.06 
 
 		 512 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  28.29 
 
 		 537 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  29.06 
 
 		 512 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  28.17 
 
 		 501 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  31 
 
 		 494 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  27.99 
 
 		 512 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  29.75 
 
 		 500 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  27.94 
 
 		 498 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  29.13 
 
 		 499 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  29.32 
 
 		 509 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  26.55 
 
 		 519 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  30.8 
 
 		 492 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  29.23 
 
 		 498 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  29.76 
 
 		 490 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  26.95 
 
 		 549 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  26.18 
 
 		 488 aa  123  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  26.07 
 
 		 492 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  29.62 
 
 		 493 aa  122  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  27.24 
 
 		 546 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 516 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 516 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 524 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  26.14 
 
 		 492 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  26.81 
 
 		 519 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  26.75 
 
 		 495 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  27.41 
 
 		 519 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  31.74 
 
 		 506 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  29.41 
 
 		 507 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  25.45 
 
 		 552 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  26.39 
 
 		 509 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  25.45 
 
 		 553 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  28.51 
 
 		 495 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2029  phytoene desaturase  27.78 
 
 		 496 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  25.32 
 
 		 499 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  28.99 
 
 		 521 aa  112  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  27.01 
 
 		 503 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  26.98 
 
 		 566 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  27.17 
 
 		 488 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  28.16 
 
 		 509 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  23.69 
 
 		 490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  25.91 
 
 		 492 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  26.72 
 
 		 492 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0318  phytoene desaturase  25.41 
 
 		 526 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158779  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  29.26 
 
 		 512 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  29.26 
 
 		 512 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  29.26 
 
 		 512 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0524  amine oxidase  26.04 
 
 		 556 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.599626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  28.95 
 
 		 506 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  26.52 
 
 		 552 aa  105  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  28.79 
 
 		 504 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  30 
 
 		 492 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  26.49 
 
 		 527 aa  105  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2891  phytoene desaturase  27.82 
 
 		 550 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.101189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6441  hydroxyneurosporene and rhodopin dehydrogenase  26.79 
 
 		 509 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0470  phytoene desaturase  28.68 
 
 		 496 aa  102  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  25.48 
 
 		 536 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  27.89 
 
 		 503 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  29.61 
 
 		 494 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>