More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2609 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  100 
 
 
610 aa  1216    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  55.7 
 
 
599 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  55.67 
 
 
599 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  55.04 
 
 
603 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  55.54 
 
 
599 aa  591  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  47.57 
 
 
520 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  48.47 
 
 
520 aa  482  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  48.28 
 
 
520 aa  480  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  45.64 
 
 
553 aa  472  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  47.92 
 
 
520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  44.7 
 
 
558 aa  465  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  43.56 
 
 
787 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  43.45 
 
 
570 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  43.12 
 
 
871 aa  455  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  47.48 
 
 
521 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  43.52 
 
 
567 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  49.19 
 
 
514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  41.99 
 
 
558 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  44.16 
 
 
561 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.86 
 
 
568 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  43.96 
 
 
553 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  41.69 
 
 
568 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.44 
 
 
563 aa  432  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.86 
 
 
568 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  42.31 
 
 
553 aa  433  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.6 
 
 
568 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  42.22 
 
 
573 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  41.46 
 
 
558 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  41.79 
 
 
570 aa  429  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  43.55 
 
 
571 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.05 
 
 
568 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.47 
 
 
568 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  46.18 
 
 
520 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  47.21 
 
 
495 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  46.47 
 
 
522 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  41.38 
 
 
570 aa  428  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.62 
 
 
564 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  47.41 
 
 
515 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  45.37 
 
 
521 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  41.57 
 
 
555 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.23 
 
 
553 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  41.95 
 
 
577 aa  425  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  42.73 
 
 
561 aa  425  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.17 
 
 
568 aa  425  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  53.03 
 
 
502 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.64 
 
 
568 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  42.36 
 
 
580 aa  422  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  47.21 
 
 
499 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  46.97 
 
 
487 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.64 
 
 
568 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  42.66 
 
 
564 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  53.03 
 
 
502 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  45.56 
 
 
521 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  43.85 
 
 
585 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  40.41 
 
 
561 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  45.56 
 
 
521 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  41.17 
 
 
568 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  45.96 
 
 
489 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  43.32 
 
 
578 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  42.2 
 
 
557 aa  418  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  47.51 
 
 
499 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  44.53 
 
 
521 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  45.31 
 
 
521 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  47.51 
 
 
499 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  43.95 
 
 
523 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  46.41 
 
 
497 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  46.85 
 
 
518 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  44.73 
 
 
557 aa  415  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  46.41 
 
 
497 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  51.67 
 
 
468 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  44.71 
 
 
563 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.51 
 
 
566 aa  415  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  46.41 
 
 
497 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  42.17 
 
 
575 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  43.93 
 
 
523 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  46.41 
 
 
497 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  50.58 
 
 
490 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  46.61 
 
 
499 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  46.41 
 
 
497 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  42.48 
 
 
550 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  47.01 
 
 
498 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  46.41 
 
 
497 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  42.24 
 
 
578 aa  415  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  41.97 
 
 
556 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  46.41 
 
 
497 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  46.81 
 
 
499 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.17 
 
 
571 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  47.01 
 
 
499 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  40.48 
 
 
888 aa  413  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  46.46 
 
 
518 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  44.05 
 
 
552 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  50.49 
 
 
494 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  50 
 
 
520 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  52.62 
 
 
469 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  46.15 
 
 
501 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  47.43 
 
 
495 aa  412  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  46.22 
 
 
497 aa  412  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  43.01 
 
 
559 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  49.1 
 
 
521 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  49.1 
 
 
521 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.11492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>