More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1690 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  485  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.653327 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  69.62 
 
 		 248 aa  318  3e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0123  ABC transporter related protein  65.68 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  57.02 
 
 		 255 aa  293  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  56.43 
 
 		 250 aa  289  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  58.09 
 
 		 245 aa  288  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  58.47 
 
 		 250 aa  285  5.999999999999999e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  55.56 
 
 		 252 aa  281  6.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  53.11 
 
 		 242 aa  275  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  54.39 
 
 		 246 aa  275  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  53.94 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  55.19 
 
 		 254 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.42 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  55.14 
 
 		 254 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  53.94 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  55.08 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  54.36 
 
 		 242 aa  269  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  53.31 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.58 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.23 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  56.3 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.3 
 
 		 244 aa  269  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.92 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  52.1 
 
 		 253 aa  267  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  56.49 
 
 		 262 aa  267  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  52.72 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.72 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  55.65 
 
 		 247 aa  265  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  53.97 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  53.14 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  55 
 
 		 244 aa  265  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  52.72 
 
 		 246 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  53.41 
 
 		 250 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3901  ABC transporter related  52.05 
 
 		 255 aa  265  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.292154  normal  0.145575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  51.85 
 
 		 247 aa  264  8.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  54.77 
 
 		 250 aa  264  8.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  51.25 
 
 		 246 aa  264  8.999999999999999e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  54.81 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.14 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  53.01 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  53.01 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  53.41 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  53.04 
 
 		 267 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  52.61 
 
 		 260 aa  263  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.7 
 
 		 249 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  52.05 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  51.87 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  54.77 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  50.63 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  53.04 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.1 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.68 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  52.54 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  53.19 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  54.39 
 
 		 251 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.78 
 
 		 516 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  53.62 
 
 		 245 aa  261  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  52.3 
 
 		 247 aa  261  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  51.6 
 
 		 263 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.78 
 
 		 510 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  55.65 
 
 		 252 aa  261  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3562  ABC transporter related  55.6 
 
 		 257 aa  261  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1436  hypothetical protein  55.04 
 
 		 247 aa  261  8e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 242 aa  261  8.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  50.85 
 
 		 242 aa  261  8.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  55.6 
 
 		 254 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  53.78 
 
 		 252 aa  261  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  54.81 
 
 		 251 aa  261  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  55.6 
 
 		 254 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  52.7 
 
 		 249 aa  260  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  51.85 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  55.14 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  52.52 
 
 		 239 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  55.6 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  54.81 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  54.39 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  51.87 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  53.81 
 
 		 257 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1658  ABC transporter related  53.14 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  55.06 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  52.08 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  53.81 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  52.74 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  52.08 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  53.63 
 
 		 254 aa  258  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  53.14 
 
 		 261 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  53.56 
 
 		 252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  52.28 
 
 		 242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  51.88 
 
 		 240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  50 
 
 		 273 aa  258  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  52.92 
 
 		 249 aa  258  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 		 270 aa  258  7e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1778  ABC transporter related  53.42 
 
 		 271 aa  258  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.77 
 
 		 254 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>