296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1816 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 174 aa  349  8.999999999999999e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  75.32 
 
 		 171 aa  239  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  70.06 
 
 		 174 aa  224  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  66.88 
 
 		 178 aa  211  4.9999999999999996e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  62.42 
 
 		 176 aa  208  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  49.31 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  47.55 
 
 		 149 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  46.53 
 
 		 151 aa  144  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  47.92 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  48.28 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  43.06 
 
 		 151 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  44.83 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  42.96 
 
 		 148 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  41.55 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  39.44 
 
 		 148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  39.44 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  39.16 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  38.3 
 
 		 155 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  37.24 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  36.62 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  37.68 
 
 		 145 aa  106  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  38.24 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  36.81 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  33.33 
 
 		 149 aa  99  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  36.11 
 
 		 149 aa  98.6  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  36.11 
 
 		 149 aa  98.6  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  36.3 
 
 		 144 aa  98.2  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  35.82 
 
 		 146 aa  97.8  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  34.03 
 
 		 149 aa  95.9  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  41.55 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  33.33 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  42.07 
 
 		 165 aa  89.4  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  37.69 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 120 aa  57  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0287  30S ribosomal protein S13  27.54 
 
 		 123 aa  54.3  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 122 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0439  ribosomal protein S13  26.15 
 
 		 125 aa  53.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 121 aa  52.8  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  30 
 
 		 123 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 121 aa  52.4  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 121 aa  52.4  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0342  30S ribosomal protein S13  26.92 
 
 		 121 aa  52  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158727  hitchhiker  0.00039866 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 122 aa  52  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 122 aa  51.6  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 122 aa  51.2  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 122 aa  51.6  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  28.37 
 
 		 123 aa  51.2  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 128 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  27.91 
 
 		 124 aa  51.2  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  30.22 
 
 		 126 aa  51.2  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  26.15 
 
 		 122 aa  50.8  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 123 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 118 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 126 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  24.62 
 
 		 122 aa  50.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3315  30S ribosomal protein S13  27.48 
 
 		 120 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  26.92 
 
 		 121 aa  50.4  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  29.77 
 
 		 122 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 118 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0204  30S ribosomal protein S13  26.62 
 
 		 129 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  29.77 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 120 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  26.15 
 
 		 127 aa  49.3  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  27.48 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  29.29 
 
 		 123 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5150  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 126 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.91661  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  29.77 
 
 		 125 aa  48.9  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  31.69 
 
 		 122 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  28.36 
 
 		 127 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  27.94 
 
 		 128 aa  48.9  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 123 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  26.15 
 
 		 125 aa  48.5  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 126 aa  48.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 116 aa  48.5  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  31.3 
 
 		 123 aa  48.5  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  27.86 
 
 		 123 aa  48.5  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  27.48 
 
 		 123 aa  48.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0789  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 121 aa  48.1  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000154932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 122 aa  48.1  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1859  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 129 aa  48.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 125 aa  48.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  26.56 
 
 		 123 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  26.92 
 
 		 122 aa  47.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>