106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1532 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 350 aa  682    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  73.5 
 
 		 354 aa  501  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  72.57 
 
 		 354 aa  494  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  60.4 
 
 		 350 aa  422  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  31.91 
 
 		 373 aa  136  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  29.69 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  33.62 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  31.61 
 
 		 356 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  29.34 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  33.24 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  26.61 
 
 		 351 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  25.97 
 
 		 742 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  27.06 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  28.34 
 
 		 344 aa  94  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  24.92 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  26.18 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  28.69 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  26.41 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  27.85 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  24.85 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  41.38 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  22.36 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  22.36 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  22.36 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  22.36 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  22.36 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  22.36 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  23.6 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  22.36 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  22.36 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  21.21 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  29.55 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  29.08 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  23.72 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  30.9 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  37.21 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  23.62 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  30.08 
 
 		 233 aa  57  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  37.27 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  30.23 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  30.46 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  29.31 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  31.96 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  33.59 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  30.85 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  24.52 
 
 		 261 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  24.83 
 
 		 257 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  29.37 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  23.36 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  34.18 
 
 		 223 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  34.44 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  24.52 
 
 		 261 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  24.85 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  23.87 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0070  transcriptional regulator, TrmB  21.94 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.432762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  23.87 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  23.87 
 
 		 261 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  22.38 
 
 		 261 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1280  transcriptional regulator, TrmB  30.49 
 
 		 262 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.755111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  28.16 
 
 		 267 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  31.43 
 
 		 275 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  24.41 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  39.39 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  28.74 
 
 		 276 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  23.23 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  23.23 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  27.18 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  35.9 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  38.33 
 
 		 255 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0183  hypothetical protein  29.72 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  30.1 
 
 		 119 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  30.83 
 
 		 270 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  31.17 
 
 		 277 aa  49.7  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  25.97 
 
 		 252 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  25.97 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  27.86 
 
 		 277 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  25.16 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  32.73 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  31.79 
 
 		 250 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  28.4 
 
 		 248 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  29.87 
 
 		 272 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  26.71 
 
 		 263 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  22.06 
 
 		 250 aa  46.6  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  21.43 
 
 		 283 aa  46.6  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  33.85 
 
 		 262 aa  46.2  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  29.87 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  29.87 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  37.31 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  24.8 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  24.05 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  25.47 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  24.84 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  36.92 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 252 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  25.97 
 
 		 252 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  26.14 
 
 		 252 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  26.14 
 
 		 252 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>