More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1465 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  100 
 
 		 400 aa  817    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  70.45 
 
 		 399 aa  585  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  69.95 
 
 		 399 aa  584  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  71.03 
 
 		 395 aa  587  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  69.95 
 
 		 395 aa  580  1e-164  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  48.23 
 
 		 395 aa  349  4e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  45.2 
 
 		 392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  45.71 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  44.58 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  44.84 
 
 		 392 aa  318  9e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  41.21 
 
 		 419 aa  312  9e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  40.39 
 
 		 398 aa  309  5e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  39.8 
 
 		 401 aa  308  8e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  41.65 
 
 		 400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  42.68 
 
 		 390 aa  305  7e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  40.75 
 
 		 400 aa  304  1.0000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  39.19 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  40.2 
 
 		 394 aa  300  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  38.52 
 
 		 392 aa  300  4e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  39.36 
 
 		 395 aa  300  4e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  38.27 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  37.76 
 
 		 392 aa  293  3e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  38.79 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  37.5 
 
 		 392 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  40.49 
 
 		 399 aa  289  6e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  39.29 
 
 		 401 aa  280  3e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  39.75 
 
 		 389 aa  276  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  39.6 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  37.78 
 
 		 401 aa  273  3e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  38.29 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  38.85 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  37.66 
 
 		 390 aa  256  7e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  35.84 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  36.23 
 
 		 403 aa  249  5e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  35.66 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  34.62 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  34.17 
 
 		 271 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.59 
 
 		 363 aa  110  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  39.66 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.64 
 
 		 363 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.59 
 
 		 363 aa  106  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  42.24 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.924801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3733  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.48 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.75 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.91 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.18 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3507  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.46 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125034  normal  0.0137315 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1734  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.6 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0584836  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.05 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04539  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.8 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.910533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0517  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.93 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2708  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  36.19 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0048  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.33 
 
 		 367 aa  103  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1055  GTP-binding protein YchF  33.58 
 
 		 354 aa  102  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  hitchhiker  0.00159487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2266  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.34 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.32 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3101  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.78 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2490  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.48 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.071382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.57 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0490059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1769  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.23 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1101  GTP-binding protein YchF  37.57 
 
 		 366 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02583  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.59 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898424  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0700  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.51 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0832  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.48 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1521  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.18 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00078802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.92 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1796  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.88 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0348  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.42 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.079313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.84 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0442  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.27 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0941  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.57 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3037  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.76 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3569  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.5 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3587  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.5 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2414  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.99 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  35.34 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1917  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.99 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1923  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.99 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1981  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.99 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4756  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.99 
 
 		 366 aa  100  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.586629  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1353  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.99 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0280261  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1537  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.99 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0518912 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3871  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.07 
 
 		 358 aa  100  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3299  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.18 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000459769  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1676  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.72 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3435  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.18 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000360155  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0986  GTP-binding protein YchF  41.51 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3999  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.35 
 
 		 365 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3257  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.18 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720126  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0503  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.18 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1110  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.18 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000114321  hitchhiker  0.00000000131179 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1923  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.19 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.264442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4159  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.35 
 
 		 365 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2002  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.43 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00393198  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3596  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.19 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0729  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.25 
 
 		 363 aa  100  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195825 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0952  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.19 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4776  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.47 
 
 		 366 aa  99.8  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117268  hitchhiker  0.000704522 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0657  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.19 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>