More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0487 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  55.39 
 
 
667 aa  712    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  55.99 
 
 
663 aa  736    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  55.99 
 
 
663 aa  736    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  55.39 
 
 
667 aa  712    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  57.12 
 
 
666 aa  765    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  57.12 
 
 
666 aa  765    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3423  transketolase  52.7 
 
 
668 aa  648    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  54.15 
 
 
665 aa  699    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  52.12 
 
 
662 aa  703    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  54.29 
 
 
670 aa  713    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  54.29 
 
 
670 aa  712    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2750  transketolase  51.8 
 
 
675 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  51.57 
 
 
664 aa  671    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  54.8 
 
 
666 aa  754    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  51.22 
 
 
662 aa  682    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  53.31 
 
 
661 aa  678    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  51.71 
 
 
663 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  54.63 
 
 
664 aa  700    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  54.9 
 
 
665 aa  716    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  51.26 
 
 
674 aa  666    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  55.11 
 
 
666 aa  754    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  52.02 
 
 
664 aa  674    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  54.95 
 
 
666 aa  752    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  51.43 
 
 
664 aa  671    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  54.95 
 
 
666 aa  753    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  53.22 
 
 
690 aa  669    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  53.45 
 
 
668 aa  732    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  56.89 
 
 
670 aa  760    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  55.51 
 
 
665 aa  717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  51.28 
 
 
665 aa  657    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  56.45 
 
 
668 aa  716    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  52.32 
 
 
690 aa  645    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  50.73 
 
 
707 aa  647    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  53.59 
 
 
670 aa  745    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  53.09 
 
 
677 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  53.26 
 
 
661 aa  671    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  57.49 
 
 
670 aa  754    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  53.37 
 
 
690 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  52.88 
 
 
665 aa  679    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  54.15 
 
 
681 aa  696    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  53.33 
 
 
664 aa  692    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  52.92 
 
 
690 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  52.49 
 
 
684 aa  697    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  55.11 
 
 
669 aa  731    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  55.11 
 
 
669 aa  746    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0178  transketolase  53.05 
 
 
668 aa  646    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  53.87 
 
 
664 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0244  transketolase  51.36 
 
 
662 aa  673    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  51.26 
 
 
674 aa  666    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  55.11 
 
 
666 aa  754    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  53.3 
 
 
668 aa  732    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  57.23 
 
 
668 aa  751    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  52.27 
 
 
671 aa  662    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  49.86 
 
 
707 aa  672    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  58.03 
 
 
688 aa  790    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  53.22 
 
 
690 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0289  transketolase  51.81 
 
 
665 aa  636    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0730452  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  52.04 
 
 
671 aa  638    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4585  transketolase  52.93 
 
 
695 aa  645    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  52.12 
 
 
667 aa  668    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  53.26 
 
 
664 aa  662    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  54.16 
 
 
663 aa  693    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4827  transketolase  52.28 
 
 
674 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.827436  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  54.52 
 
 
662 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  51.97 
 
 
694 aa  686    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  52.69 
 
 
680 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  52.81 
 
 
664 aa  682    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  51.74 
 
 
671 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0353  transketolase  53.12 
 
 
663 aa  660    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  56.08 
 
 
663 aa  718    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  50.75 
 
 
665 aa  655    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  53.23 
 
 
659 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  51.59 
 
 
665 aa  681    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  56.34 
 
 
697 aa  754    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  52.11 
 
 
667 aa  671    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  53.29 
 
 
690 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  57.92 
 
 
691 aa  770    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  54.17 
 
 
666 aa  707    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  54.6 
 
 
662 aa  709    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  55.07 
 
 
672 aa  720    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  54.93 
 
 
664 aa  706    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  55.08 
 
 
664 aa  709    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  54.73 
 
 
666 aa  665    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  54.68 
 
 
665 aa  671    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  52.05 
 
 
680 aa  681    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  53.44 
 
 
690 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  54.9 
 
 
665 aa  706    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  51.13 
 
 
658 aa  644    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  51.13 
 
 
658 aa  655    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  53.29 
 
 
690 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  57.92 
 
 
691 aa  770    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  55.98 
 
 
655 aa  705    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  55.08 
 
 
664 aa  711    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  52.46 
 
 
692 aa  696    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  53.2 
 
 
668 aa  646    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  53.77 
 
 
671 aa  723    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  53.22 
 
 
690 aa  669    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  54 
 
 
663 aa  690    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  53.47 
 
 
667 aa  689    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  51.66 
 
 
668 aa  636    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>