229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0950 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  100 
 
 		 205 aa  427  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  51.85 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  33.85 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  45.69 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  39.62 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  38.51 
 
 		 164 aa  104  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  43.97 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  40.16 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  38.52 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  43.75 
 
 		 291 aa  94  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.52 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  36.64 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  39.42 
 
 		 175 aa  88.2  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  35.94 
 
 		 174 aa  85.5  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  35.77 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  41.27 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  34.68 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  34.68 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  35.42 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  32.61 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  34.78 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  33.87 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  37.88 
 
 		 139 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.9 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  36.36 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  30.87 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  34.38 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  34.71 
 
 		 331 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  42.37 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  38.93 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.2 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  36.44 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  30.99 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  38.41 
 
 		 470 aa  58.5  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.89 
 
 		 312 aa  54.3  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  40.2 
 
 		 412 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  36.27 
 
 		 517 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  33.06 
 
 		 388 aa  54.3  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  39.22 
 
 		 400 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  39.22 
 
 		 420 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  39.22 
 
 		 421 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  39.22 
 
 		 421 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  33.79 
 
 		 385 aa  52  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  38.83 
 
 		 425 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  32.43 
 
 		 418 aa  51.6  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  38.36 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  35.63 
 
 		 406 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  30.56 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.82 
 
 		 321 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  34.44 
 
 		 314 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  32.5 
 
 		 475 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  34.31 
 
 		 350 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  30.65 
 
 		 417 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  33.98 
 
 		 477 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  33.98 
 
 		 477 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  37.86 
 
 		 425 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  33.98 
 
 		 448 aa  48.9  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  34.31 
 
 		 350 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  33.01 
 
 		 479 aa  48.5  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  35.9 
 
 		 457 aa  48.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  33.05 
 
 		 473 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  33.33 
 
 		 375 aa  48.5  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  32.2 
 
 		 480 aa  48.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  33.05 
 
 		 475 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  32.61 
 
 		 300 aa  48.1  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  34.95 
 
 		 447 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  37.37 
 
 		 464 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  37.04 
 
 		 457 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  37.62 
 
 		 440 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  34.95 
 
 		 468 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1627  M24/M37 family peptidase  31.39 
 
 		 386 aa  47.8  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  35.53 
 
 		 447 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  34.41 
 
 		 471 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  33.05 
 
 		 473 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  40.45 
 
 		 399 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  36.96 
 
 		 369 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  36.96 
 
 		 319 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1544  peptidase M23B  35.56 
 
 		 336 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  35.35 
 
 		 406 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  35.53 
 
 		 447 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  43.06 
 
 		 334 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  33.05 
 
 		 472 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  33.05 
 
 		 474 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  39.73 
 
 		 754 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  27.78 
 
 		 302 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  34.02 
 
 		 490 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  33.66 
 
 		 472 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  33.96 
 
 		 458 aa  47  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  32.69 
 
 		 503 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  32.98 
 
 		 313 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  36.84 
 
 		 446 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  32.2 
 
 		 475 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  32.65 
 
 		 491 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  34.04 
 
 		 362 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  33.05 
 
 		 503 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  36.73 
 
 		 402 aa  46.2  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  32.93 
 
 		 464 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  36 
 
 		 317 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  39.33 
 
 		 399 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  46.27 
 
 		 296 aa  46.2  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>