More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0215 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  100 
 
 		 321 aa  654    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  60.58 
 
 		 326 aa  368  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  34.15 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  36.79 
 
 		 234 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  38.71 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  34.59 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  33.56 
 
 		 253 aa  132  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  34.05 
 
 		 252 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  33.95 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  32.62 
 
 		 238 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  33.11 
 
 		 239 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  39.69 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  43.43 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  35.16 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  35.52 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  38.86 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  34.4 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  40.81 
 
 		 241 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  36.67 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  38.35 
 
 		 261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  40.71 
 
 		 228 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  37.15 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  34.5 
 
 		 227 aa  119  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  39.01 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  40.1 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  38.82 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  36.49 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  39.17 
 
 		 242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  37.95 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  32.98 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  39.09 
 
 		 255 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  39 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  34.44 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  39.36 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  31.37 
 
 		 228 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  41.71 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  42.08 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  38.12 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  41.53 
 
 		 255 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  33.1 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  35.32 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  36.36 
 
 		 257 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  42.31 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  40.96 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  30.97 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  37.8 
 
 		 223 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  38.46 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  37.02 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  40.88 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  30.53 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  36.36 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  38.83 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  35.47 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  35.56 
 
 		 254 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  39.89 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2806  hypothetical protein  33.44 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  hitchhiker  0.00000205022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  38.37 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  32.78 
 
 		 270 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  35.98 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  34.39 
 
 		 246 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  33.11 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  33.94 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  37.3 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  34.26 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  42.29 
 
 		 256 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  33.03 
 
 		 242 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  37.39 
 
 		 236 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  33.03 
 
 		 242 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  35.45 
 
 		 245 aa  99.4  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  39.19 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  38.5 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  37.73 
 
 		 252 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  32.97 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  35.71 
 
 		 247 aa  97.1  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  32.22 
 
 		 229 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  33.33 
 
 		 243 aa  96.3  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  33.48 
 
 		 240 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  34.5 
 
 		 253 aa  95.9  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  41.81 
 
 		 255 aa  95.9  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  35.29 
 
 		 263 aa  95.9  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  32.67 
 
 		 240 aa  95.5  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  34.84 
 
 		 242 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2137  hypothetical protein  33.44 
 
 		 270 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2089  hypothetical protein  38.89 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  35.75 
 
 		 242 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  27.46 
 
 		 251 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  33.03 
 
 		 242 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  33.03 
 
 		 246 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  29.86 
 
 		 241 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  34.11 
 
 		 264 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  39.38 
 
 		 257 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  33.94 
 
 		 246 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0490  protein of unknown function DUF152  34.95 
 
 		 254 aa  95.1  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000444061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  36.53 
 
 		 252 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  34.11 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  31.74 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>