More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2490 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 
248 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  80.24 
 
 
248 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  79.35 
 
 
249 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  52.87 
 
 
251 aa  259  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  54.96 
 
 
242 aa  258  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  53.69 
 
 
245 aa  259  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  53.69 
 
 
245 aa  259  4e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  54.69 
 
 
250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  56.61 
 
 
251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  56.73 
 
 
246 aa  257  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  52.05 
 
 
245 aa  249  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  50.61 
 
 
252 aa  247  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  51.37 
 
 
281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  47.13 
 
 
245 aa  226  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  48.35 
 
 
245 aa  225  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  51.04 
 
 
256 aa  222  4e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  50.21 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  50.21 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  46.72 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  44.76 
 
 
261 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  44.08 
 
 
247 aa  208  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  46.4 
 
 
263 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  43.44 
 
 
246 aa  204  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  45.9 
 
 
247 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  46 
 
 
256 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  45.2 
 
 
256 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  45.2 
 
 
256 aa  202  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  43.43 
 
 
264 aa  201  9e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  42.04 
 
 
248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  40.72 
 
 
670 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.53 
 
 
646 aa  121  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  38.34 
 
 
659 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  39.11 
 
 
572 aa  105  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  32.71 
 
 
568 aa  104  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  33.82 
 
 
568 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  31.7 
 
 
553 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.78 
 
 
794 aa  89.7  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.41 
 
 
777 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.86 
 
 
777 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5702  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.68 
 
 
1550 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.9 
 
 
776 aa  72  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  30.67 
 
 
771 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.64 
 
 
1524 aa  68.9  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.3 
 
 
1521 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.63 
 
 
1474 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  29.68 
 
 
1465 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.39 
 
 
635 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.71 
 
 
793 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  27.57 
 
 
1479 aa  64.3  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  28.83 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.1 
 
 
777 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  25.93 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.85 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1686  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.17 
 
 
1537 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647876 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  28.21 
 
 
1515 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  26.7 
 
 
227 aa  62.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  28.75 
 
 
771 aa  62.4  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.76 
 
 
236 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.55 
 
 
381 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  27.95 
 
 
228 aa  62  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  27.08 
 
 
1486 aa  62  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3166  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.51 
 
 
1516 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.563815  normal  0.707717 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2217  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.98 
 
 
1516 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  28.83 
 
 
1530 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  29.41 
 
 
228 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.51 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16351  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.96 
 
 
1531 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  30.52 
 
 
1475 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.6 
 
 
1527 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  25.85 
 
 
1482 aa  60.1  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  28.18 
 
 
1482 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.52 
 
 
1475 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1691  glutamate synthase (NADH) large subunit  27.23 
 
 
1519 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103385  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.49 
 
 
1512 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  26.42 
 
 
228 aa  59.3  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0007  glutamate synthase, large subunit  26.09 
 
 
1496 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  28.51 
 
 
227 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0007  glutamate synthase, large subunit  26.09 
 
 
1495 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000781352  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0033  glutamate synthase, large subunit  26.09 
 
 
1495 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.281504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.64 
 
 
247 aa  58.9  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  27.01 
 
 
228 aa  58.9  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.98 
 
 
1487 aa  58.5  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5123  glutamate synthase, large subunit  27.96 
 
 
1481 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  28.51 
 
 
227 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25 
 
 
1529 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  26.58 
 
 
1516 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.45 
 
 
1530 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  29.14 
 
 
1482 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0894  glutamate synthase (ferredoxin)  27.88 
 
 
1528 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.08401  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25 
 
 
1475 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13895  ferredoxin-dependent glutamate synthase [NADPH] large subunit gltB  29.67 
 
 
1527 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.79 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  33.88 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  28.57 
 
 
1487 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  29.93 
 
 
1483 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  26.58 
 
 
1516 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1253  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.57 
 
 
1479 aa  57  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0265  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.79 
 
 
1584 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568336  normal  0.146722 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  28.57 
 
 
1487 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  28.34 
 
 
1482 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.843249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>