More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3309 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  100 
 
 		 494 aa  967    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  54.44 
 
 		 507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  53.4 
 
 		 506 aa  451  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  52.78 
 
 		 509 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  51.3 
 
 		 519 aa  451  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  53.94 
 
 		 492 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  53.71 
 
 		 503 aa  443  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  53.41 
 
 		 492 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  52.8 
 
 		 492 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  52.61 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  55.04 
 
 		 502 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  51.3 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  51.8 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  51.8 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  51.6 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  52.1 
 
 		 506 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  46.22 
 
 		 489 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  48.32 
 
 		 494 aa  349  5e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0484  phytoene desaturase  42.83 
 
 		 493 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0470  phytoene desaturase  41.58 
 
 		 496 aa  278  2e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  36.03 
 
 		 492 aa  252  8.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  30.54 
 
 		 492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  36.24 
 
 		 525 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  33.01 
 
 		 505 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  31.17 
 
 		 493 aa  228  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  33.27 
 
 		 504 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  33.47 
 
 		 497 aa  226  7e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  34.67 
 
 		 492 aa  219  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  33.88 
 
 		 491 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  29.86 
 
 		 511 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  31.06 
 
 		 504 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  34.35 
 
 		 508 aa  217  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  26.94 
 
 		 537 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  32.67 
 
 		 508 aa  216  8e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  31.03 
 
 		 504 aa  216  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  29.78 
 
 		 511 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  29.96 
 
 		 511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  31.16 
 
 		 490 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  33.13 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  33.4 
 
 		 530 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  33.4 
 
 		 530 aa  208  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  32 
 
 		 507 aa  207  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  26.64 
 
 		 502 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  26.64 
 
 		 502 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  33.47 
 
 		 507 aa  205  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  29.14 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  31.61 
 
 		 498 aa  203  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  30.9 
 
 		 519 aa  202  9e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  28.77 
 
 		 497 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  34.17 
 
 		 536 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  30.32 
 
 		 498 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  31.37 
 
 		 495 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  30.26 
 
 		 531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  29.92 
 
 		 519 aa  196  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  33.12 
 
 		 530 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  31.24 
 
 		 529 aa  196  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  29.52 
 
 		 518 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  31.42 
 
 		 508 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  31.94 
 
 		 495 aa  193  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  29.64 
 
 		 491 aa  192  8e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  30.79 
 
 		 518 aa  192  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  30.18 
 
 		 512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  31.31 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  30.04 
 
 		 512 aa  190  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  30 
 
 		 512 aa  190  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  25.45 
 
 		 494 aa  190  5e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  30.46 
 
 		 553 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  28.17 
 
 		 495 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  29.92 
 
 		 509 aa  186  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2029  phytoene desaturase  31.16 
 
 		 496 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  32.38 
 
 		 508 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  29.22 
 
 		 499 aa  183  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  32.58 
 
 		 508 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  29.13 
 
 		 521 aa  183  8.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  29.62 
 
 		 492 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  30.16 
 
 		 524 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  25.35 
 
 		 488 aa  180  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  29.47 
 
 		 500 aa  180  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  29.86 
 
 		 512 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  29.66 
 
 		 518 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  29.66 
 
 		 518 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  28.41 
 
 		 527 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  23.68 
 
 		 488 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  32.61 
 
 		 566 aa  177  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 		 516 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  27.77 
 
 		 501 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1073  phytoene dehydrogenase-related protein  29.73 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 524 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3491  phytoene desaturase  34.22 
 
 		 551 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  24.95 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3693  phytoene desaturase  33.73 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1614  phytoene dehydrogenase-related protein  31.99 
 
 		 520 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  31.37 
 
 		 548 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 516 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  23.51 
 
 		 499 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  28.62 
 
 		 546 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  28.41 
 
 		 549 aa  166  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  27.47 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  28.12 
 
 		 509 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  33.53 
 
 		 495 aa  162  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>