More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2831 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 224 aa  433  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  55.76 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  53.81 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4647  transcriptional regulator, GntR family  48.34 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 214 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  38.92 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 263 aa  99  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 235 aa  98.6  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  37.32 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  24 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  30.45 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6220  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 266 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 260 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 293 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 267 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 215 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 225 aa  91.7  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 215 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 257 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  33.33 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 245 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 245 aa  87.4  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  33.18 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 252 aa  86.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 249 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  35.12 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 238 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 240 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 232 aa  85.5  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  85.1  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  32.7 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 221 aa  84.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.7 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  32.7 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>