161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2061 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  54.46 
 
 		 910 aa  709    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  54.98 
 
 		 1100 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  100 
 
 		 671 aa  1336    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  51.11 
 
 		 1087 aa  649    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  51.63 
 
 		 1087 aa  645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  53.42 
 
 		 1079 aa  697    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  48.88 
 
 		 1083 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  48.53 
 
 		 1082 aa  600  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  46.82 
 
 		 927 aa  572  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 		 919 aa  558  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  45.64 
 
 		 919 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  45.83 
 
 		 903 aa  537  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.09 
 
 		 1088 aa  535  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  44.04 
 
 		 913 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  42.33 
 
 		 906 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.71 
 
 		 917 aa  505  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  44.76 
 
 		 935 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 920 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  42 
 
 		 1039 aa  477  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 1071 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 932 aa  472  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 901 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 1172 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 894 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  39.6 
 
 		 894 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 894 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  39.75 
 
 		 1323 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 897 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.9 
 
 		 945 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.03 
 
 		 1316 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 		 1323 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 896 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  37.24 
 
 		 1150 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 1168 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  34.89 
 
 		 950 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  38.32 
 
 		 1159 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  38.32 
 
 		 1159 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 1152 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.4 
 
 		 1179 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.59 
 
 		 1156 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 		 893 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 1168 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 		 1172 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 1175 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  36.42 
 
 		 1169 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  38.79 
 
 		 1169 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 1070 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 		 1069 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  38.74 
 
 		 1161 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 		 1069 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.095908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 		 1158 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 1159 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.63 
 
 		 1168 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  37 
 
 		 1157 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.83 
 
 		 1158 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 1070 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 		 1169 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 		 1169 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.09 
 
 		 1159 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 		 1169 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 1159 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 1163 aa  372  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1170 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 1171 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  37.08 
 
 		 1174 aa  363  4e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 		 1169 aa  361  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 1174 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 		 1167 aa  359  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 		 1168 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 1168 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  34.7 
 
 		 1145 aa  346  7e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 		 1140 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1146 aa  334  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 		 1145 aa  334  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 1146 aa  334  4e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1146 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  34.23 
 
 		 1146 aa  333  9e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1146 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 1146 aa  327  5e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 1140 aa  326  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1146 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 		 1172 aa  323  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  34.23 
 
 		 1142 aa  323  6e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 1159 aa  323  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 		 1140 aa  320  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  33.03 
 
 		 1177 aa  310  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 885 aa  310  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00597808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  33.13 
 
 		 1147 aa  310  8e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  34.91 
 
 		 1148 aa  307  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  33.99 
 
 		 1141 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 1177 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.38 
 
 		 1156 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1166 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 1145 aa  282  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 1138 aa  278  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1152 aa  277  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 		 1161 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 981 aa  271  4e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000864337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  31.32 
 
 		 1006 aa  269  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  31.94 
 
 		 1055 aa  269  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>