77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3701 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  100 
 
 		 151 aa  317  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  73.39 
 
 		 183 aa  204  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  73.17 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  68.38 
 
 		 181 aa  201  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  74.38 
 
 		 180 aa  201  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  61.36 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  56.93 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  56.2 
 
 		 184 aa  173  9e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  55.8 
 
 		 183 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  54.17 
 
 		 188 aa  147  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.17 
 
 		 197 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  46.15 
 
 		 191 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.97 
 
 		 191 aa  95.9  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  35.34 
 
 		 189 aa  90.9  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  36.21 
 
 		 186 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.7 
 
 		 189 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  37.07 
 
 		 182 aa  84.3  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  35.34 
 
 		 205 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.73 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.75 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.75 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  32.73 
 
 		 207 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.73 
 
 		 188 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  31.58 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  31.67 
 
 		 219 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  31.67 
 
 		 186 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  31.48 
 
 		 208 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.64 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  34.55 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  29.75 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.46 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  33.03 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.43 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  33.64 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  32.5 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  31.25 
 
 		 180 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.59 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  31.82 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.46 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.96 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.17 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  27.93 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.84 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.68 
 
 		 178 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.2 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  23.89 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  23.89 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.89 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.37 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.36 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  33 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28.28 
 
 		 225 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  33 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  29.46 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  28.43 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.55 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.53 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.55 
 
 		 172 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.26 
 
 		 181 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  30.63 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  26.98 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  27.84 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  31.31 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.17 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.98 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  26.72 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.29 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  27.19 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  27.27 
 
 		 183 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  26.8 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0517  hypothetical protein  30 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  25.23 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.42 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>