129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0243 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  528  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  69.2 
 
 
252 aa  362  4e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  67.72 
 
 
254 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  70.24 
 
 
252 aa  350  8.999999999999999e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  55.33 
 
 
253 aa  280  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  56.97 
 
 
252 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  54.36 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  52.85 
 
 
255 aa  247  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  52.78 
 
 
257 aa  245  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  49 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  48.2 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  48.46 
 
 
236 aa  209  4e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  43.15 
 
 
246 aa  206  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  44.16 
 
 
251 aa  202  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  45.73 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  41.46 
 
 
248 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  43.97 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  48.04 
 
 
259 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  47.76 
 
 
203 aa  190  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  40 
 
 
252 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  39.32 
 
 
246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  35.78 
 
 
251 aa  151  8e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  35.87 
 
 
382 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  38.5 
 
 
244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  32.26 
 
 
221 aa  112  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  42.11 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  34.72 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  36.15 
 
 
225 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  32.2 
 
 
202 aa  108  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  33.63 
 
 
356 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  33.65 
 
 
239 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  34.81 
 
 
214 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  36.19 
 
 
235 aa  98.6  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  34.87 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  35.03 
 
 
234 aa  95.9  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  32.43 
 
 
237 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  32.58 
 
 
242 aa  89.4  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.16 
 
 
391 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  31.75 
 
 
392 aa  85.5  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  29.26 
 
 
205 aa  85.5  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  29.26 
 
 
189 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  23.71 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  34.9 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  29.26 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.81 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  29.74 
 
 
508 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  29.74 
 
 
508 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  26.17 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  27.84 
 
 
510 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  26.87 
 
 
357 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  28.82 
 
 
458 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  28.72 
 
 
510 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  28.35 
 
 
509 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.22 
 
 
461 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  28.72 
 
 
503 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  34.09 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  26.47 
 
 
474 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  28.19 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  28.72 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  30.84 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  31.37 
 
 
491 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  30.94 
 
 
529 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  26.15 
 
 
523 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  31.22 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  25.45 
 
 
475 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  27.63 
 
 
473 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  25.9 
 
 
656 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  32 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  30.88 
 
 
221 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  30.43 
 
 
282 aa  58.5  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  37.11 
 
 
559 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  30.72 
 
 
354 aa  56.6  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  25.74 
 
 
518 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  31.79 
 
 
222 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  29.45 
 
 
532 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  29.85 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  26.44 
 
 
513 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  26.44 
 
 
513 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  27.01 
 
 
513 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  26.44 
 
 
513 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  26.44 
 
 
513 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  27.08 
 
 
202 aa  54.3  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  33.59 
 
 
513 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  29.81 
 
 
558 aa  53.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  27.48 
 
 
518 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  23.33 
 
 
471 aa  53.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  25.61 
 
 
547 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  31.25 
 
 
491 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  29.12 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  29.73 
 
 
513 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  26.9 
 
 
217 aa  52.4  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  28.04 
 
 
217 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  28.04 
 
 
262 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  28.04 
 
 
217 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  28.04 
 
 
217 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  28.04 
 
 
217 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  28.04 
 
 
217 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  28.04 
 
 
305 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  29.72 
 
 
250 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>