211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1911 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  100 
 
 		 256 aa  510  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  48.19 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.45 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  38.84 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.28 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  35.6 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  38.96 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  34.4 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.64 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  30.83 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.25 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  33.49 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  35.29 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  35.62 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  30.08 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.08 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.08 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  34.62 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  32.88 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  32.34 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  30.67 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  28.75 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.29 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  30.09 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0650  putative hydratase  31.56 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  30.09 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.07 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  30.09 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  29.96 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  34.21 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3446  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.06 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.08 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  29.49 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  27.41 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2908  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.25 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0561  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  29.46 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0212  hypothetical protein  32.62 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  29.2 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.75 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  28.73 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.39 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2504  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.22 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1165  putative hydratase protein  30.84 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3056  hydratase/decarboxylase family protein  27.35 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  28.57 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  30.24 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.72 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.66 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  30.24 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  28.51 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.21 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  28.84 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.88 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  28.5 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  29.76 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  27.31 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.79 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.47 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  27.15 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0200  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.91 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.428998  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.74 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.91 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.78 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.46 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.91 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.53 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.53 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.53 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  24.53 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.53 
 
 		 269 aa  62  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  25 
 
 		 269 aa  62  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.2 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.14 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.84 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2075  hydratase/decarboxylase family protein  21.81 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488863  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  29.37 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1158  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.76 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  27.8 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5928  hydratase/decarboxylase  28.36 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0876  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.94 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2889  hydratase/decarboxylase  31.29 
 
 		 169 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.39 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.88 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  27.71 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.17 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.82 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.18 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5826  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  28.45 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242898  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.26 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.19 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.21 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.43 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.28 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.19 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.68 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.63 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  26.15 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.32 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.32 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  29 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>