More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0030 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 263 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  54.02 
 
 		 257 aa  265  7e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  54.23 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  55.73 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  53.46 
 
 		 271 aa  256  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  53.26 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  53.61 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  55.21 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  52.87 
 
 		 260 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  54.83 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  54.62 
 
 		 267 aa  248  6e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  51.34 
 
 		 260 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  53.26 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  52.67 
 
 		 265 aa  245  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  53.26 
 
 		 263 aa  245  6e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 		 263 aa  241  9e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  51.91 
 
 		 265 aa  240  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  52.09 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  50.95 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  54.14 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  51.91 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  50.77 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  50.38 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  50.19 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  50.76 
 
 		 263 aa  228  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  49.43 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  49.81 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  43.85 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  48.66 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  48.47 
 
 		 267 aa  225  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  48.85 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  50.19 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  50.87 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  47.33 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  42.31 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  44.83 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  50.38 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  47.13 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  46.39 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  46.92 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  45.42 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  40.77 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  45 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  39.62 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  46.01 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  44.11 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  46.15 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  46.74 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  46.74 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  42.75 
 
 		 262 aa  202  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  40.53 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  42.64 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  46.59 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  38.08 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  45.83 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  42.97 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  39.77 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  44.57 
 
 		 459 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  44.27 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  40.68 
 
 		 262 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  41.06 
 
 		 263 aa  195  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  41.13 
 
 		 262 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  44.24 
 
 		 290 aa  194  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  44.7 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  44.16 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  42.96 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  40.89 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  43.13 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  41.06 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  41.35 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  43.56 
 
 		 260 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  45.08 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  44.94 
 
 		 264 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  42.16 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  42.16 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  42.16 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  42.16 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  38.26 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  44.32 
 
 		 260 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  38.26 
 
 		 255 aa  192  7e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  43.33 
 
 		 269 aa  191  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  42.53 
 
 		 254 aa  191  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  42.8 
 
 		 280 aa  191  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  43.23 
 
 		 270 aa  191  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  42.44 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  37.93 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  40.6 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  43.68 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  43.94 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  41.22 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  42.11 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  42.11 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  43.68 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  42.8 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  43.68 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  42.96 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  41.73 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  37.31 
 
 		 257 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  38.35 
 
 		 266 aa  188  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  39.69 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>