More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4808 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4808  ammonium transporter  100 
 
 		 456 aa  907    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  48.55 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  45.87 
 
 		 429 aa  328  9e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  45.81 
 
 		 456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  42.51 
 
 		 417 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  40 
 
 		 474 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  43.51 
 
 		 447 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  41.82 
 
 		 432 aa  306  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  40.37 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  42.07 
 
 		 466 aa  299  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  46.14 
 
 		 445 aa  299  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  43.28 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  43.28 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  43.28 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  39.83 
 
 		 465 aa  296  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  41.2 
 
 		 477 aa  295  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  39.4 
 
 		 427 aa  293  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  42.82 
 
 		 442 aa  292  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  41.45 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  40.09 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  40.43 
 
 		 435 aa  286  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  41.29 
 
 		 434 aa  286  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  39.48 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  40.88 
 
 		 429 aa  284  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  39.02 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  40.19 
 
 		 406 aa  276  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  37.97 
 
 		 457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  39.16 
 
 		 450 aa  272  8.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  41.93 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  42.07 
 
 		 478 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  40.2 
 
 		 402 aa  266  4e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  38.98 
 
 		 459 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2710  ammonium transporter  39.16 
 
 		 402 aa  266  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  37.3 
 
 		 442 aa  266  8e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  40.68 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  39.95 
 
 		 451 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  40.88 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  41.28 
 
 		 439 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  38.39 
 
 		 450 aa  263  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  40.44 
 
 		 408 aa  261  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  40.47 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  36.79 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  36.79 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  36.79 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  38.04 
 
 		 424 aa  260  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2057  ammonium transporter  41.63 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00112408  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  39.71 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  40.53 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  39.66 
 
 		 429 aa  256  4e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  38.15 
 
 		 449 aa  256  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  39.17 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  40.2 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  39.08 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  39.36 
 
 		 457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  39.08 
 
 		 410 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  38.83 
 
 		 410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  38.83 
 
 		 410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  38.69 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  38.35 
 
 		 410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  38.83 
 
 		 410 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  38.64 
 
 		 488 aa  253  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  38.59 
 
 		 410 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  38.35 
 
 		 410 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0086  ammonium transporter  39.15 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  39.05 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  37.47 
 
 		 450 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  40.95 
 
 		 433 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  37.5 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  41.83 
 
 		 397 aa  249  7e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  38.66 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  39.71 
 
 		 431 aa  249  9e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  37.05 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  37.81 
 
 		 485 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  38.98 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  36.57 
 
 		 450 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  38.86 
 
 		 515 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  38.46 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  38.35 
 
 		 405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  39.19 
 
 		 451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  38.65 
 
 		 470 aa  246  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  36.98 
 
 		 462 aa  246  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  39 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0157  hypothetical protein  38.86 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  38.24 
 
 		 515 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  39.86 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  38.95 
 
 		 466 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  39.43 
 
 		 466 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  38.06 
 
 		 496 aa  243  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  38.82 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  39.43 
 
 		 437 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  40.05 
 
 		 432 aa  242  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  38.61 
 
 		 436 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  38.72 
 
 		 466 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  37.44 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  37.64 
 
 		 507 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  38.01 
 
 		 461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  39.81 
 
 		 437 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  37.35 
 
 		 441 aa  240  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  38.69 
 
 		 462 aa  240  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  37.13 
 
 		 397 aa  240  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>