More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3427 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  100 
 
 
433 aa  837    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  67.85 
 
 
439 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  67.47 
 
 
439 aa  488  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  56.85 
 
 
439 aa  480  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  59.47 
 
 
432 aa  472  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  60.23 
 
 
456 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  57.37 
 
 
446 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  55.83 
 
 
474 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  60.34 
 
 
456 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  59.09 
 
 
447 aa  448  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  60.34 
 
 
478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  56.65 
 
 
429 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  55.32 
 
 
459 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  61.14 
 
 
445 aa  438  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  53.35 
 
 
427 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  54.93 
 
 
466 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  57.21 
 
 
434 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  60.68 
 
 
438 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  55.58 
 
 
441 aa  428  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  53.35 
 
 
465 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  54.86 
 
 
435 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  56.94 
 
 
424 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  50.93 
 
 
457 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  56.34 
 
 
449 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  56.03 
 
 
451 aa  408  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  51.71 
 
 
446 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  54.06 
 
 
440 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  55.1 
 
 
434 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  51.71 
 
 
446 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  55.88 
 
 
450 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  51.71 
 
 
446 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  54.39 
 
 
467 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  51.25 
 
 
450 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  54.48 
 
 
477 aa  395  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  51.39 
 
 
438 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  53.08 
 
 
457 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  51.84 
 
 
405 aa  391  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  54.88 
 
 
442 aa  388  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  52.85 
 
 
450 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  53.55 
 
 
451 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  50.34 
 
 
442 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  52.1 
 
 
431 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  53.98 
 
 
443 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  50.5 
 
 
444 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  50.12 
 
 
434 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  52.29 
 
 
429 aa  378  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  52.72 
 
 
464 aa  378  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  50.98 
 
 
436 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  49.07 
 
 
489 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  53.07 
 
 
405 aa  375  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  48.59 
 
 
488 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  52.55 
 
 
461 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  48.66 
 
 
433 aa  370  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  48.21 
 
 
450 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2342  ammonium transporter  53.56 
 
 
455 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.602093 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  51.11 
 
 
408 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  51.35 
 
 
408 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  48.29 
 
 
410 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  54.43 
 
 
401 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  53.06 
 
 
438 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  49.27 
 
 
461 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  53.06 
 
 
438 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  47.89 
 
 
485 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  48.78 
 
 
410 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  50.84 
 
 
417 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  47.95 
 
 
494 aa  363  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  50.86 
 
 
408 aa  363  3e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  51.33 
 
 
504 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  48.48 
 
 
507 aa  363  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  48.78 
 
 
410 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  50.12 
 
 
462 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  47.54 
 
 
515 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  51.33 
 
 
502 aa  362  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  48.05 
 
 
411 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  48.54 
 
 
410 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  49.64 
 
 
501 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  48.29 
 
 
410 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  48.48 
 
 
496 aa  360  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  48.17 
 
 
410 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  48.29 
 
 
410 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  50.6 
 
 
466 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  50.6 
 
 
500 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  50.6 
 
 
500 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  50.6 
 
 
466 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  50.6 
 
 
466 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  50.6 
 
 
444 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  50.6 
 
 
478 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  50.37 
 
 
433 aa  359  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  53.38 
 
 
441 aa  359  6e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  52.1 
 
 
423 aa  359  7e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  47.07 
 
 
515 aa  359  7e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  51.2 
 
 
445 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  48.05 
 
 
410 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  48.28 
 
 
402 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  50.25 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  50.6 
 
 
500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  50.84 
 
 
499 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  50.6 
 
 
500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  50.6 
 
 
500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  52.18 
 
 
468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.943388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>