More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2078 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  100 
 
 		 450 aa  880    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  73.05 
 
 		 446 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  73.05 
 
 		 446 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  73.05 
 
 		 446 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  70.6 
 
 		 442 aa  608  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  70.55 
 
 		 450 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  70.33 
 
 		 450 aa  589  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  64.84 
 
 		 438 aa  535  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  63.47 
 
 		 441 aa  530  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  64.92 
 
 		 435 aa  524  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  62.16 
 
 		 424 aa  497  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  60.32 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  55.51 
 
 		 459 aa  460  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  55.3 
 
 		 474 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  52.7 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  50.45 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  51.91 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  52.86 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  52.4 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  50.22 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  52.56 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  51.58 
 
 		 447 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  49.43 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  51.97 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  48.1 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  49.21 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  49.09 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  48.78 
 
 		 439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  49.45 
 
 		 441 aa  356  5.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  47.95 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  45.62 
 
 		 439 aa  351  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  46.77 
 
 		 465 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  50.11 
 
 		 438 aa  349  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  48.99 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  47.33 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  47.66 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  45.29 
 
 		 429 aa  346  6e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  45.5 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  44.17 
 
 		 427 aa  340  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  46.88 
 
 		 417 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  44.39 
 
 		 431 aa  332  9e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  43.32 
 
 		 428 aa  326  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  48.13 
 
 		 442 aa  325  9e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  45.7 
 
 		 429 aa  323  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  50.34 
 
 		 420 aa  323  5e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  44.97 
 
 		 467 aa  322  7e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  42.53 
 
 		 405 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  47.98 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  43.62 
 
 		 438 aa  316  5e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  43.97 
 
 		 434 aa  315  9e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  47.2 
 
 		 417 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  47.2 
 
 		 417 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  47.2 
 
 		 417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  43.26 
 
 		 451 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  42.64 
 
 		 436 aa  310  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  40.36 
 
 		 434 aa  310  4e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  42.89 
 
 		 449 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  42.08 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  43.4 
 
 		 462 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  41.99 
 
 		 461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  40.81 
 
 		 457 aa  306  7e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  40.38 
 
 		 500 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  43.24 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  42.37 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  43.67 
 
 		 464 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  41.03 
 
 		 500 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  42.2 
 
 		 494 aa  301  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  40.55 
 
 		 499 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  43.05 
 
 		 488 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2526  ammonium transporter  43.05 
 
 		 424 aa  299  7e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  42.25 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  42.35 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  40.54 
 
 		 433 aa  298  2e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  43.35 
 
 		 504 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  43.72 
 
 		 454 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  42.79 
 
 		 411 aa  296  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  42.34 
 
 		 410 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  41.08 
 
 		 444 aa  296  6e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  42.63 
 
 		 413 aa  296  7e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  43.45 
 
 		 500 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  41.45 
 
 		 431 aa  295  8e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  43.45 
 
 		 500 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  43.45 
 
 		 500 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  41.67 
 
 		 513 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  42.42 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  43.68 
 
 		 500 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  42.57 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  42.57 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  42.57 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  42.28 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  42.12 
 
 		 449 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  41.57 
 
 		 411 aa  294  3e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  42.6 
 
 		 476 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  40.99 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  41.54 
 
 		 436 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  41.88 
 
 		 498 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  42.76 
 
 		 444 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  42.76 
 
 		 478 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  42.44 
 
 		 452 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  40.59 
 
 		 397 aa  293  4e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>