More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1699 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  100 
 
 		 413 aa  818    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  64.41 
 
 		 411 aa  545  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  55.88 
 
 		 467 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  54.07 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  54.61 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  51.23 
 
 		 410 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  50.74 
 
 		 411 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  50.98 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  50.98 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  50.74 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  50.49 
 
 		 410 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  50.25 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  50.25 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  50.25 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0776  ammonia permease  50 
 
 		 398 aa  378  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  51.35 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  49.75 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1679  ammonia permease  48.77 
 
 		 448 aa  372  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  51.6 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  45.95 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2526  ammonium transporter  49.53 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  48.66 
 
 		 428 aa  363  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  49.02 
 
 		 449 aa  361  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  47.52 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  48.01 
 
 		 431 aa  359  6e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  46.45 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  47.42 
 
 		 438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  49.64 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  49.75 
 
 		 453 aa  349  7e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  45.64 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  46.91 
 
 		 454 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  47.3 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  47.3 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  46.99 
 
 		 436 aa  342  8e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  50.74 
 
 		 402 aa  342  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  50.85 
 
 		 470 aa  341  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  46.68 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  44.74 
 
 		 431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  46.59 
 
 		 464 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  46.19 
 
 		 406 aa  338  8e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  46.23 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  46.29 
 
 		 431 aa  335  7e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  46.21 
 
 		 472 aa  335  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  44.83 
 
 		 444 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  45.8 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  46.96 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  44.12 
 
 		 405 aa  333  3e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  49.88 
 
 		 401 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  44.88 
 
 		 445 aa  332  7.000000000000001e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  44.2 
 
 		 466 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  45.17 
 
 		 469 aa  332  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  44.2 
 
 		 466 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  44.2 
 
 		 500 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  44.2 
 
 		 500 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  44.2 
 
 		 466 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  44.2 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  45.81 
 
 		 432 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  44.2 
 
 		 478 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  47.04 
 
 		 405 aa  330  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  45.99 
 
 		 427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  46.04 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  47.48 
 
 		 445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  45.68 
 
 		 402 aa  326  5e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  42.86 
 
 		 494 aa  325  6e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  43.8 
 
 		 500 aa  325  9e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  43.8 
 
 		 500 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  43.8 
 
 		 500 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  43.8 
 
 		 500 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  42.93 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  43.52 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  45.19 
 
 		 397 aa  323  3e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  44.28 
 
 		 430 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  43.96 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  44.28 
 
 		 430 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  44.28 
 
 		 430 aa  323  4e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.447574 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  46.19 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  44.16 
 
 		 477 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  45.26 
 
 		 499 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  44.33 
 
 		 402 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  45.57 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  44.14 
 
 		 446 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  45.45 
 
 		 515 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  44.77 
 
 		 502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  45.8 
 
 		 459 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  43.07 
 
 		 504 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  47.28 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  43.32 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  45.81 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  45.57 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  49.26 
 
 		 402 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  43.63 
 
 		 439 aa  319  5e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  47.67 
 
 		 408 aa  319  6e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  47.24 
 
 		 433 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  44.29 
 
 		 442 aa  318  7.999999999999999e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  44.23 
 
 		 435 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  44.42 
 
 		 478 aa  318  7.999999999999999e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  47.67 
 
 		 408 aa  318  9e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  44.74 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  45.07 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  43.03 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>