More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5072 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  100 
 
 		 440 aa  848    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  63.59 
 
 		 429 aa  501  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  62.05 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  63.61 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  63.37 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  63.37 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  62.5 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  59.49 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  58.53 
 
 		 447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  54.94 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  53.95 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  52.16 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  52.8 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  56.6 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  52.76 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  53.32 
 
 		 474 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  53.81 
 
 		 478 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  52.48 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  53.33 
 
 		 456 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  50.8 
 
 		 442 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  55 
 
 		 477 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  55.16 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  51.5 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  52.82 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  52.66 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  50.96 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  52.48 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  48.99 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  48.99 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  48.99 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  50.57 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  51.76 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  48.67 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  49.21 
 
 		 450 aa  364  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  50.6 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  50.34 
 
 		 450 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  50.95 
 
 		 439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  48.93 
 
 		 439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  52.94 
 
 		 433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  51.95 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  52.48 
 
 		 439 aa  352  8e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4808  ammonium transporter  48.55 
 
 		 456 aa  344  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  47.84 
 
 		 443 aa  342  7e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  51.07 
 
 		 441 aa  338  8e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  50 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  47.97 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  47.61 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  48.63 
 
 		 467 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  45.69 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  47.47 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  46.41 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  44.71 
 
 		 411 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  47.24 
 
 		 431 aa  322  7e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  45.22 
 
 		 410 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  44.98 
 
 		 410 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  44.5 
 
 		 410 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  44.98 
 
 		 410 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  44.93 
 
 		 488 aa  319  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2710  ammonium transporter  46.57 
 
 		 402 aa  319  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  45.93 
 
 		 405 aa  319  7e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  44.74 
 
 		 410 aa  318  9e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  44.74 
 
 		 410 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  45.73 
 
 		 451 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  43.91 
 
 		 489 aa  317  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  45.52 
 
 		 515 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  44.5 
 
 		 410 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  45.29 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  47.61 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2057  ammonium transporter  47.71 
 
 		 404 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00112408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  44.19 
 
 		 507 aa  313  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  45.41 
 
 		 485 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  43.96 
 
 		 496 aa  312  9e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  44.6 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  44.17 
 
 		 397 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  43.61 
 
 		 402 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  46.14 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  45.78 
 
 		 438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  44.98 
 
 		 462 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  45.78 
 
 		 438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  45.12 
 
 		 398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  43.75 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  45.8 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  46.45 
 
 		 464 aa  303  5.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  46.41 
 
 		 408 aa  302  1e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  46.15 
 
 		 408 aa  300  3e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  45.54 
 
 		 401 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  44.77 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0086  ammonium transporter  44.08 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  42.86 
 
 		 399 aa  299  6e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  44.58 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  45.6 
 
 		 459 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  45.78 
 
 		 408 aa  297  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  42.44 
 
 		 436 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  48.08 
 
 		 401 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0566  ammonium transporter  40.86 
 
 		 427 aa  296  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0404362  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  41.99 
 
 		 515 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  42.92 
 
 		 476 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  42.21 
 
 		 524 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  49.05 
 
 		 420 aa  296  5e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  44.1 
 
 		 480 aa  296  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>