More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1061 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  100 
 
 		 461 aa  898    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  65.77 
 
 		 451 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  64.34 
 
 		 467 aa  547  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  67.16 
 
 		 434 aa  547  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  66.11 
 
 		 457 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  60.14 
 
 		 462 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  62.22 
 
 		 449 aa  500  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  59.75 
 
 		 411 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  59.75 
 
 		 410 aa  494  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  59.75 
 
 		 410 aa  497  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  59.24 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  59.75 
 
 		 410 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  59.75 
 
 		 410 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  59.75 
 
 		 410 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  59.51 
 
 		 410 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  59.75 
 
 		 410 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  59.51 
 
 		 410 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  58.85 
 
 		 405 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  60 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  55.66 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  59.6 
 
 		 405 aa  435  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  57.64 
 
 		 411 aa  428  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  54.78 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  59.41 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  56.19 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  59.06 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  54.78 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  55.37 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  57.53 
 
 		 408 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  55.26 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  57.53 
 
 		 408 aa  420  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  55.24 
 
 		 470 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  51.6 
 
 		 406 aa  420  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  57.53 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  53.01 
 
 		 466 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  54.5 
 
 		 444 aa  415  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  53.01 
 
 		 466 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  53.01 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  53.01 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  53.01 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  53.01 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  53.01 
 
 		 466 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  53.25 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  52.29 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  53.25 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  53.25 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  52.77 
 
 		 500 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  53.92 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  55.22 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  52.53 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  54.65 
 
 		 459 aa  405  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  52.74 
 
 		 463 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  54.61 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  53.32 
 
 		 436 aa  405  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  52.74 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  52.66 
 
 		 489 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  55.09 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  51.38 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  54.98 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  54.08 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  50.84 
 
 		 501 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  52.22 
 
 		 488 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  52.96 
 
 		 515 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  54.27 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  52.96 
 
 		 515 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  51.52 
 
 		 485 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  53.1 
 
 		 402 aa  395  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  50.62 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  53.86 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  50.94 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  51.33 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  49.64 
 
 		 411 aa  389  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  51.87 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  51.15 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  51.99 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  52.93 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  50 
 
 		 445 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  55.22 
 
 		 423 aa  385  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  52.29 
 
 		 497 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  52.29 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  50.6 
 
 		 502 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  50.82 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  49.15 
 
 		 470 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  52.53 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  50 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  50.46 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  50.5 
 
 		 399 aa  378  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  49.31 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  50.84 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  50.98 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  48.4 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  51.13 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  52.89 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  53.54 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  50 
 
 		 427 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  53.3 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  52.08 
 
 		 480 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  49.39 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  51.61 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  51.61 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>