More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2068 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  100 
 
 
406 aa  807    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  59.01 
 
 
434 aa  475  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  55.31 
 
 
449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  54.57 
 
 
467 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  55.42 
 
 
451 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  53.2 
 
 
410 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  52.96 
 
 
410 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  52.46 
 
 
410 aa  448  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  53.69 
 
 
410 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  52.46 
 
 
411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  52.71 
 
 
410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  52.96 
 
 
410 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  52.71 
 
 
410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  52.71 
 
 
410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  58.02 
 
 
408 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  57.78 
 
 
408 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  57.28 
 
 
408 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  52.46 
 
 
462 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  54.46 
 
 
402 aa  434  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  53.87 
 
 
398 aa  431  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  56.44 
 
 
411 aa  426  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  54.09 
 
 
402 aa  425  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  55.08 
 
 
397 aa  426  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  52.14 
 
 
397 aa  412  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  51.11 
 
 
405 aa  408  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  49.38 
 
 
405 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  53.03 
 
 
400 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  51.6 
 
 
461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  49.14 
 
 
457 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  51.9 
 
 
399 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  51.97 
 
 
453 aa  388  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  48.5 
 
 
398 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  49.88 
 
 
402 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  48.78 
 
 
428 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  51.45 
 
 
429 aa  375  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  46.7 
 
 
488 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  50.12 
 
 
464 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0157  hypothetical protein  50.25 
 
 
399 aa  373  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  47.9 
 
 
470 aa  368  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  46.46 
 
 
515 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  50.37 
 
 
401 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0771  ammonium transporter  50.5 
 
 
396 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00637331  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  46.46 
 
 
485 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  45.35 
 
 
489 aa  364  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  50.37 
 
 
431 aa  365  1e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  50.12 
 
 
402 aa  364  1e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  51.59 
 
 
438 aa  364  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  46.26 
 
 
515 aa  363  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  46.42 
 
 
496 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  45.5 
 
 
507 aa  361  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  47.85 
 
 
472 aa  359  5e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  49.26 
 
 
462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  50.37 
 
 
454 aa  354  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  45.85 
 
 
433 aa  351  1e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  47.41 
 
 
401 aa  350  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  49.51 
 
 
455 aa  349  6e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  47.39 
 
 
453 aa  348  9e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  47.04 
 
 
438 aa  346  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  47.04 
 
 
438 aa  346  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2342  ammonium transporter  46.8 
 
 
455 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.602093 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1698  ammonium transporter  42.79 
 
 
521 aa  345  6e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.300416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  48.04 
 
 
434 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  44.23 
 
 
435 aa  342  7e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  48.64 
 
 
435 aa  340  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  44.2 
 
 
427 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  50.25 
 
 
397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06675  ammonium transporter  45.91 
 
 
427 aa  339  5e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  47.29 
 
 
444 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  46.37 
 
 
470 aa  338  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  43.46 
 
 
429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  42.52 
 
 
467 aa  335  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1270  ammonium transporter  49.28 
 
 
461 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  46.6 
 
 
432 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  45.63 
 
 
500 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  45.63 
 
 
500 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  45.63 
 
 
500 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  45.87 
 
 
500 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  45.15 
 
 
504 aa  332  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  43.38 
 
 
405 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2464  ammonium transporter  46.93 
 
 
456 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3314  ammonium transporter  48.89 
 
 
442 aa  331  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2376  ammonium transporter  46.68 
 
 
456 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1491  ammonium transporter  46.68 
 
 
456 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.936264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  45.63 
 
 
500 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  45.63 
 
 
500 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  45.63 
 
 
466 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  45.63 
 
 
466 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  45.63 
 
 
466 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  45.63 
 
 
444 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  45.63 
 
 
478 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  45.39 
 
 
469 aa  329  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  48.16 
 
 
423 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1347  ammonium transporter  49.5 
 
 
442 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  45.05 
 
 
431 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  43.87 
 
 
432 aa  326  5e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  45 
 
 
436 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  42.55 
 
 
463 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  44.47 
 
 
439 aa  323  5e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  45.5 
 
 
437 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  43.69 
 
 
501 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>