More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2786 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  100 
 
 		 398 aa  780    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  73.62 
 
 		 400 aa  586  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  67.76 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  65.83 
 
 		 399 aa  526  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  65.59 
 
 		 402 aa  523  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  66.67 
 
 		 402 aa  523  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  65.91 
 
 		 397 aa  511  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  57.93 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0157  hypothetical protein  59.55 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0771  ammonium transporter  57.69 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00637331  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  59.35 
 
 		 408 aa  437  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  59.35 
 
 		 408 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  58.85 
 
 		 408 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  53.87 
 
 		 406 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  53.63 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  55.31 
 
 		 434 aa  408  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  53.96 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  52.61 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  53.85 
 
 		 467 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  50.87 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  51.88 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  50.12 
 
 		 488 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  50.48 
 
 		 489 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  48.69 
 
 		 515 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  51.24 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  48.46 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  48.69 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  47.89 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  48.14 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  48.14 
 
 		 410 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  48.39 
 
 		 410 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  47.89 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  47.89 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  51.25 
 
 		 405 aa  375  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  47.89 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  47.39 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  50.62 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  51.01 
 
 		 402 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  48.26 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  47.15 
 
 		 410 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  50.63 
 
 		 464 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  48.51 
 
 		 431 aa  364  1e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  48.23 
 
 		 507 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  47.75 
 
 		 496 aa  360  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  51.39 
 
 		 402 aa  358  7e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  46.63 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  51.62 
 
 		 411 aa  355  5e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  48.51 
 
 		 444 aa  354  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  49 
 
 		 438 aa  353  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  49 
 
 		 438 aa  353  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  49.25 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  51.01 
 
 		 401 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  48.18 
 
 		 504 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  49 
 
 		 431 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  47.45 
 
 		 500 aa  342  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  47.57 
 
 		 474 aa  342  9e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  48.51 
 
 		 435 aa  341  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  48.37 
 
 		 432 aa  341  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  47.2 
 
 		 500 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  52.38 
 
 		 423 aa  340  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  47.2 
 
 		 500 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  47.2 
 
 		 500 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  46.41 
 
 		 472 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  46.23 
 
 		 466 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  46.23 
 
 		 466 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  46.23 
 
 		 466 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  46.23 
 
 		 500 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  46.23 
 
 		 500 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  46.47 
 
 		 444 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  46.47 
 
 		 478 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  48.88 
 
 		 433 aa  335  9e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  45.54 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  46.23 
 
 		 469 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  47.45 
 
 		 499 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1698  ammonium transporter  43.33 
 
 		 521 aa  332  6e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.300416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  50.98 
 
 		 439 aa  332  8e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  45.79 
 
 		 435 aa  332  9e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  47.76 
 
 		 470 aa  331  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  44.76 
 
 		 463 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  46.04 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  46.55 
 
 		 461 aa  329  7e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  45.98 
 
 		 401 aa  328  7e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  47.93 
 
 		 503 aa  328  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  46.62 
 
 		 429 aa  328  8e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  47.93 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  44.25 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  48.74 
 
 		 397 aa  325  9e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  43.89 
 
 		 434 aa  325  9e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  47.24 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  46.47 
 
 		 502 aa  322  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  45.23 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  45.72 
 
 		 427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  45.84 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  42.08 
 
 		 405 aa  319  5e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  49.04 
 
 		 456 aa  319  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  43.71 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  44.86 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  45.75 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  45 
 
 		 453 aa  316  4e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  43.78 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>