More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2267 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  100 
 
 		 405 aa  801    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  70.79 
 
 		 405 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  63.25 
 
 		 449 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  66.34 
 
 		 402 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  61.94 
 
 		 457 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  61.35 
 
 		 467 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  63.68 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  60 
 
 		 451 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  64.11 
 
 		 401 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  64.6 
 
 		 402 aa  471  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  61.23 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  58.6 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  60.64 
 
 		 401 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  55.53 
 
 		 410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  55.53 
 
 		 411 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  60.1 
 
 		 461 aa  442  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  55.77 
 
 		 410 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  55.28 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  55.53 
 
 		 410 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  55.53 
 
 		 410 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  55.28 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  55.67 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  55.28 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  51.36 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  56.27 
 
 		 411 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  56.44 
 
 		 408 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  56.19 
 
 		 408 aa  420  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  56.19 
 
 		 408 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  51.73 
 
 		 402 aa  412  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  53.58 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  53.68 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  54.18 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  53.28 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  53.1 
 
 		 472 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  52.56 
 
 		 489 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  54.61 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  51.18 
 
 		 488 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  51.25 
 
 		 398 aa  393  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  52.03 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  50.58 
 
 		 515 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  51.05 
 
 		 515 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  56.44 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  52.21 
 
 		 428 aa  388  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  51.84 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  50.61 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  52.61 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  50.82 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  53.32 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  50 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  52.14 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  51.48 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  53.32 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  50.73 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  51.04 
 
 		 496 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  50.37 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  50.61 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  50.35 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  51.22 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  50.37 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  51.22 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  51.54 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  51.22 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  50.61 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1270  ammonium transporter  51.81 
 
 		 461 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  50.24 
 
 		 444 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  50.24 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  50.24 
 
 		 478 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  51.22 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  49.26 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  50.24 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  48.63 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  50.98 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  50.24 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  50.24 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  49.88 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  50.24 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  46.31 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  48.54 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  49.27 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  51.21 
 
 		 501 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  49.27 
 
 		 466 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  49.27 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  49.76 
 
 		 469 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  49.02 
 
 		 466 aa  364  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  49.38 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  48.91 
 
 		 431 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  49.12 
 
 		 399 aa  362  5.0000000000000005e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  50.49 
 
 		 432 aa  362  9e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  51.11 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  50.99 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  49.37 
 
 		 398 aa  358  7e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  51.85 
 
 		 433 aa  358  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  48.51 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  50.87 
 
 		 454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  48.39 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  51.78 
 
 		 459 aa  356  3.9999999999999996e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  48.7 
 
 		 474 aa  356  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  48.89 
 
 		 430 aa  355  7.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  45.68 
 
 		 405 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  44.99 
 
 		 433 aa  354  1e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>