More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0142 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  100 
 
 		 464 aa  898    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  59.56 
 
 		 451 aa  511  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  63.88 
 
 		 434 aa  505  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  59.53 
 
 		 457 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  59.24 
 
 		 461 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  61.32 
 
 		 467 aa  490  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  60.99 
 
 		 405 aa  477  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  56.06 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  58.37 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  54.48 
 
 		 428 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  61.23 
 
 		 405 aa  443  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  54.19 
 
 		 410 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  54.03 
 
 		 411 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  54.73 
 
 		 410 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  54.73 
 
 		 410 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  54.73 
 
 		 410 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  54.19 
 
 		 410 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  54.23 
 
 		 410 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  54.48 
 
 		 410 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  58.31 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  54.23 
 
 		 410 aa  428  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  54.89 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  58.72 
 
 		 408 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  53 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  56.82 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  58.72 
 
 		 408 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  57.86 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  56.47 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  57.29 
 
 		 401 aa  398  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  57.28 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  51.08 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  51.12 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  50.98 
 
 		 436 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  49.43 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  50.12 
 
 		 406 aa  388  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  50.71 
 
 		 438 aa  385  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  50 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  51.36 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  50.71 
 
 		 438 aa  385  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  50.75 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  50.73 
 
 		 444 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  50.73 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  55.28 
 
 		 411 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  50.63 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  50.73 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  51.09 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  50.73 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  50.97 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  51.39 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  49.32 
 
 		 472 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  49.16 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  50.73 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  50.73 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  50.73 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  48.17 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  51.75 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  50.73 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  50.85 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  50.58 
 
 		 438 aa  375  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  49.52 
 
 		 463 aa  375  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  48.2 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  50.61 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  50.61 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  50.61 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  50.85 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  49 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  49.44 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  50.12 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  54.8 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  51.77 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  49.63 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  51.41 
 
 		 400 aa  372  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  51.06 
 
 		 489 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  48.5 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  49.04 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  50.12 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  49.65 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  50.59 
 
 		 485 aa  364  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1270  ammonium transporter  50.57 
 
 		 461 aa  364  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  47.99 
 
 		 399 aa  363  4e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  52.71 
 
 		 442 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  48.96 
 
 		 470 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  52.46 
 
 		 442 aa  362  9e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  52.02 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  48.32 
 
 		 437 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  48.56 
 
 		 437 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  48.32 
 
 		 466 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  48.32 
 
 		 466 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  51.33 
 
 		 456 aa  360  4e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  48.56 
 
 		 437 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  49.4 
 
 		 459 aa  359  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  51.46 
 
 		 503 aa  359  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  51.46 
 
 		 497 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  52.33 
 
 		 445 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  51.36 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  46.59 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  49.32 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  48.49 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  47.71 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  53.4 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>