More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1508 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  81.99 
 
 		 489 aa  710    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  100 
 
 		 515 aa  1016    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  87.06 
 
 		 488 aa  756    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  83.41 
 
 		 496 aa  696    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  95.53 
 
 		 515 aa  895    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  81.31 
 
 		 507 aa  695    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  85.41 
 
 		 485 aa  733    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  61.38 
 
 		 423 aa  487  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  55.84 
 
 		 451 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  55.19 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  53.65 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  53.41 
 
 		 411 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  53.65 
 
 		 410 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  52.71 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  52.94 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  52.94 
 
 		 410 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  52.94 
 
 		 410 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  52.71 
 
 		 410 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  52.71 
 
 		 410 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  52.22 
 
 		 457 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  54.25 
 
 		 467 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  53.3 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  53.18 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  53.4 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  53.7 
 
 		 397 aa  395  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  54.2 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  54.2 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  51.64 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  54.2 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  54.2 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  54.2 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  54.2 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  54.2 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  50 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  52.35 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  53.96 
 
 		 469 aa  389  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  51.06 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0086  ammonium transporter  50 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  53.18 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  52.96 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  51.05 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  53 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  53 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0566  ammonium transporter  47.39 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0404362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  53 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  51.06 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  49.18 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  48.46 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  52.52 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  50.12 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  50.59 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  51.9 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  53.4 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  52.81 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0089  ammonium transporter  48.98 
 
 		 443 aa  375  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  50.59 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  49.06 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  49.55 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  50.12 
 
 		 405 aa  375  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  48.47 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  50.45 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  50.45 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1999  ammonium transporter  49.54 
 
 		 444 aa  372  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  48.71 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  49.03 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2672  ammonium transporter  49.77 
 
 		 443 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000545054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  46.46 
 
 		 406 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  50 
 
 		 428 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  47.69 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  51.66 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  48.94 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0094  ammonium transporter  48.27 
 
 		 443 aa  363  4e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.162623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  52.04 
 
 		 499 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  53 
 
 		 503 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  47.35 
 
 		 449 aa  363  6e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  53 
 
 		 497 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  51.08 
 
 		 502 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  47.69 
 
 		 432 aa  361  2e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  47.87 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  48.33 
 
 		 397 aa  359  6e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  51.84 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  52.3 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  48.96 
 
 		 435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  51.29 
 
 		 411 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  46.55 
 
 		 444 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  50.11 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  50 
 
 		 464 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0128  ammonium transporter  48.39 
 
 		 441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0306677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  53.35 
 
 		 444 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  47.65 
 
 		 434 aa  351  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  53.02 
 
 		 443 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  47.89 
 
 		 429 aa  350  4e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  48.94 
 
 		 454 aa  349  5e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0107  ammonium transporter  48.96 
 
 		 444 aa  350  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  47.45 
 
 		 432 aa  349  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  47.36 
 
 		 466 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  46.15 
 
 		 432 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  45.81 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1698  ammonium transporter  44.23 
 
 		 521 aa  347  4e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.300416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0178  ammonium transporter  48.89 
 
 		 482 aa  346  5e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>