More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2920 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  92.94 
 
 
444 aa  774    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  92.94 
 
 
478 aa  774    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  90.87 
 
 
504 aa  821    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  92.46 
 
 
469 aa  772    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  75.9 
 
 
502 aa  691    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  91.2 
 
 
500 aa  808    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  91 
 
 
500 aa  816    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  77.76 
 
 
499 aa  688    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  91 
 
 
500 aa  808    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  83.5 
 
 
466 aa  781    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  100 
 
 
497 aa  970    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  80.24 
 
 
501 aa  739    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  83.5 
 
 
466 aa  781    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  83.5 
 
 
466 aa  781    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  85.6 
 
 
500 aa  784    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  91 
 
 
500 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  92.05 
 
 
503 aa  814    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  85.6 
 
 
500 aa  784    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  68.07 
 
 
438 aa  568  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  68.07 
 
 
438 aa  568  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  64.89 
 
 
431 aa  519  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  59.82 
 
 
444 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  63.81 
 
 
459 aa  492  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  59.52 
 
 
433 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  62.5 
 
 
445 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  59.85 
 
 
432 aa  481  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  60.53 
 
 
435 aa  476  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  60.91 
 
 
466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  61.57 
 
 
433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  64.75 
 
 
443 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  62.7 
 
 
442 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  56.83 
 
 
434 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  63.17 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  63.68 
 
 
438 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  60.05 
 
 
427 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  57.01 
 
 
463 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  64.11 
 
 
444 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  67.07 
 
 
449 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  64.27 
 
 
443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  60.49 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  55.3 
 
 
436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  62.21 
 
 
445 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0178  ammonium transporter  56.91 
 
 
482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  63.88 
 
 
445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  54.84 
 
 
513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  64.27 
 
 
443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  54.79 
 
 
494 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  56.95 
 
 
436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  54.15 
 
 
515 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  51.53 
 
 
499 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  59.59 
 
 
433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  53.92 
 
 
524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  53.81 
 
 
461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  54.15 
 
 
510 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  56.12 
 
 
499 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  50.41 
 
 
498 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  50.22 
 
 
500 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  50.44 
 
 
500 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  51.42 
 
 
498 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2331  ammonium transporter  56.63 
 
 
446 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  51.2 
 
 
498 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  55.56 
 
 
439 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  54.74 
 
 
443 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  53.42 
 
 
504 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  51.74 
 
 
480 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  54.57 
 
 
472 aa  422  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  53.49 
 
 
477 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  52.15 
 
 
441 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  49.67 
 
 
500 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  57.7 
 
 
468 aa  420  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0473  ammonium transporter  56.16 
 
 
522 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  52.87 
 
 
445 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  52.87 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0184  ammonium transporter  54.57 
 
 
515 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.186841  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  50.88 
 
 
480 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  47.97 
 
 
506 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0272  ammonium transporter  50.11 
 
 
480 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  52.63 
 
 
437 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  52.84 
 
 
441 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  51.6 
 
 
452 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  52.33 
 
 
476 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  57.04 
 
 
457 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  52.87 
 
 
437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  52.56 
 
 
436 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  52.39 
 
 
437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  53.23 
 
 
449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  49.79 
 
 
466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0172  putative ammonium transporter transmembrane protein  53.97 
 
 
508 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17564  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  52.39 
 
 
437 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  51.67 
 
 
480 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  52.38 
 
 
466 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  50.11 
 
 
466 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  51.53 
 
 
432 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0121  ammonium transporter  54.34 
 
 
521 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0596893 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  52.32 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0278  ammonium transporter  49.78 
 
 
480 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  50.49 
 
 
428 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0495  ammonium transporter  50.49 
 
 
428 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0373  ammonium transporter  50 
 
 
480 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  50.49 
 
 
428 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>