More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2526 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  100 
 
 		 438 aa  863    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  100 
 
 		 438 aa  863    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  70.22 
 
 		 444 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  70.22 
 
 		 478 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  70.22 
 
 		 500 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  70.22 
 
 		 466 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  69.98 
 
 		 469 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  70.22 
 
 		 466 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  70.22 
 
 		 500 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  70.22 
 
 		 466 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  69.98 
 
 		 500 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  69.98 
 
 		 500 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  69.98 
 
 		 500 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  69.98 
 
 		 500 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  69.73 
 
 		 501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  69.01 
 
 		 504 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  69.25 
 
 		 503 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  67.55 
 
 		 499 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  67.8 
 
 		 502 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  69.25 
 
 		 497 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  68.46 
 
 		 431 aa  535  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  67.86 
 
 		 435 aa  531  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  65.63 
 
 		 444 aa  522  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  66.11 
 
 		 463 aa  519  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  66.83 
 
 		 459 aa  502  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  62.44 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  70.65 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  62.19 
 
 		 445 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  61.76 
 
 		 433 aa  477  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  59.37 
 
 		 436 aa  475  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  62.75 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  57.32 
 
 		 432 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  58.62 
 
 		 434 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  62.44 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  64.18 
 
 		 442 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  62.88 
 
 		 442 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  63.78 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  62.1 
 
 		 444 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  65.62 
 
 		 445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  60.46 
 
 		 438 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  64.16 
 
 		 443 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  53.06 
 
 		 499 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  63.2 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  55.89 
 
 		 436 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  63.2 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  54.34 
 
 		 494 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  54.59 
 
 		 500 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  54.97 
 
 		 515 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  54.03 
 
 		 500 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  54.97 
 
 		 524 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  55.87 
 
 		 427 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  61.15 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  54.5 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  53.4 
 
 		 498 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  55.5 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  54.15 
 
 		 498 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  55.89 
 
 		 443 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  53.58 
 
 		 510 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  55.97 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  55.85 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  55.5 
 
 		 437 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  56.1 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  56.14 
 
 		 436 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  57.04 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  55.61 
 
 		 437 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  55.96 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  53.06 
 
 		 498 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  50.85 
 
 		 506 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  55.31 
 
 		 445 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  55.47 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  54.73 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  51.33 
 
 		 480 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  57.28 
 
 		 439 aa  420  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  54.78 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  56.39 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  58.84 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  56.93 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  53.18 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0272  ammonium transporter  50.65 
 
 		 480 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  51.2 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  55.4 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  51.97 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  54.12 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0278  ammonium transporter  51.22 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  52.61 
 
 		 504 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  54.68 
 
 		 466 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  54.68 
 
 		 466 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  54.93 
 
 		 466 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  56 
 
 		 457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  51.74 
 
 		 476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  55.72 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2331  ammonium transporter  55.2 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  53.73 
 
 		 457 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0184  ammonium transporter  53.97 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  53.35 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  53.57 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0373  ammonium transporter  50.89 
 
 		 480 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  53.35 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0178  ammonium transporter  53.38 
 
 		 482 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  53.35 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.447574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>