More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1019 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  100 
 
 
451 aa  892    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  71.6 
 
 
434 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  69.03 
 
 
467 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  66.82 
 
 
457 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  65.77 
 
 
461 aa  566  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  64.37 
 
 
462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  62.99 
 
 
449 aa  524  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  61.58 
 
 
410 aa  511  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  60.99 
 
 
410 aa  511  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  60.84 
 
 
410 aa  512  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  61.23 
 
 
410 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  60.99 
 
 
411 aa  510  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  61.33 
 
 
410 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  61.33 
 
 
410 aa  510  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  60.49 
 
 
410 aa  508  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  61.08 
 
 
410 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  59.56 
 
 
464 aa  505  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  58.97 
 
 
405 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  55.42 
 
 
406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  61.23 
 
 
411 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  59.51 
 
 
405 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  60.99 
 
 
402 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  54.91 
 
 
470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  59.27 
 
 
408 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  59.27 
 
 
408 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  55.84 
 
 
515 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  59.02 
 
 
408 aa  435  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  55.2 
 
 
515 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  59.01 
 
 
402 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  54.97 
 
 
429 aa  431  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  54.91 
 
 
488 aa  428  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  54.63 
 
 
428 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  53.94 
 
 
489 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  53.99 
 
 
444 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  54.08 
 
 
485 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  55.35 
 
 
472 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  54.05 
 
 
402 aa  420  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  55.4 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  55.47 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  54.57 
 
 
402 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  53.96 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  54.65 
 
 
463 aa  418  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  55.4 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  58.52 
 
 
401 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  52.4 
 
 
496 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  53.09 
 
 
507 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  50.79 
 
 
436 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  53.35 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  53.3 
 
 
438 aa  404  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  54.09 
 
 
397 aa  404  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  54.42 
 
 
459 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  54.57 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  54.63 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  53.2 
 
 
397 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  54.29 
 
 
444 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  52.31 
 
 
500 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  52.31 
 
 
444 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  52.31 
 
 
466 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  50.75 
 
 
470 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  52.31 
 
 
478 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  51.94 
 
 
504 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  52.31 
 
 
469 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  52.31 
 
 
500 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  50.93 
 
 
433 aa  397  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  52.31 
 
 
466 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  52.31 
 
 
466 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  52.97 
 
 
435 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  51.7 
 
 
500 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  47.46 
 
 
467 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  51.94 
 
 
500 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  51.94 
 
 
500 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  50.58 
 
 
431 aa  392  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  51.94 
 
 
500 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  52.07 
 
 
501 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  53.32 
 
 
433 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  52.46 
 
 
429 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  50.72 
 
 
427 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  52.45 
 
 
436 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  52.07 
 
 
499 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  50.35 
 
 
432 aa  387  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  50.72 
 
 
443 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  55.5 
 
 
423 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  52.31 
 
 
502 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  48.64 
 
 
494 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  54.63 
 
 
445 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  53.32 
 
 
438 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  53.04 
 
 
442 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  46.84 
 
 
500 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  50 
 
 
452 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  53.04 
 
 
442 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  49.76 
 
 
453 aa  375  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1270  ammonium transporter  53.86 
 
 
461 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  49.63 
 
 
399 aa  376  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  47.91 
 
 
434 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  49.64 
 
 
461 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  58.13 
 
 
449 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  52.18 
 
 
503 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  52.18 
 
 
497 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  48.16 
 
 
435 aa  378  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  49.77 
 
 
432 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>