More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0294 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  100 
 
 		 436 aa  854    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  83.09 
 
 		 433 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  77.27 
 
 		 443 aa  656    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  54.69 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  55.61 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  56.22 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  56.22 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  53.44 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  53.41 
 
 		 437 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  52.84 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  53.66 
 
 		 437 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  53.9 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  53.17 
 
 		 437 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  53.27 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  53.27 
 
 		 444 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  53.27 
 
 		 478 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  53.03 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  53.68 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  53.27 
 
 		 466 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  54.92 
 
 		 433 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  53.27 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  53.27 
 
 		 466 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  53.27 
 
 		 466 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  52.26 
 
 		 504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  53.51 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  51.04 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  51.04 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  53.51 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  52.44 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  53.03 
 
 		 500 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  53.51 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  51.09 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  57.74 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  51.33 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  52.78 
 
 		 502 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  52.3 
 
 		 499 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  50.24 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  49.88 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  51.97 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  51.09 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  53.92 
 
 		 461 aa  395  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  54.48 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  51.54 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  53.51 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  53.51 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  54.99 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  52.45 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  49.51 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  49.08 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  50.72 
 
 		 464 aa  382  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  50.36 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  47.11 
 
 		 494 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  47.81 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  50.36 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  50.74 
 
 		 449 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  51.23 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  48.88 
 
 		 434 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  50.37 
 
 		 405 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  50.97 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  47.95 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  42.74 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  50.58 
 
 		 438 aa  365  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  48.33 
 
 		 439 aa  363  4e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  47.2 
 
 		 480 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  47.41 
 
 		 427 aa  362  9e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  46.5 
 
 		 477 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  46.85 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  45.81 
 
 		 513 aa  360  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  47.24 
 
 		 430 aa  359  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  47.24 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  47.24 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.447574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  47.24 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  46.85 
 
 		 515 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  47 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  49.38 
 
 		 480 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  46.14 
 
 		 476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  47.04 
 
 		 428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  49.52 
 
 		 442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  46.95 
 
 		 524 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  49.52 
 
 		 442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  47.04 
 
 		 428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  47.04 
 
 		 428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0513  ammonium transporter  47.04 
 
 		 428 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0566  ammonium transporter  47.04 
 
 		 428 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.887749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0178  ammonium transporter  49.3 
 
 		 482 aa  355  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  49.4 
 
 		 445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  43.14 
 
 		 500 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0490  ammonium transporter  47 
 
 		 431 aa  353  5e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.641765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  47.39 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  48.12 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  45.58 
 
 		 510 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  46.57 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  47.87 
 
 		 410 aa  351  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  48.12 
 
 		 410 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  47.87 
 
 		 410 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  47.87 
 
 		 410 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  47.62 
 
 		 410 aa  348  7e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  47.15 
 
 		 410 aa  348  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  42.23 
 
 		 498 aa  348  8e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  49.02 
 
 		 468 aa  348  9e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>