More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0866 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  100 
 
 		 402 aa  791    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  83.04 
 
 		 402 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  79.6 
 
 		 401 aa  578  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  65.59 
 
 		 405 aa  520  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  65.67 
 
 		 401 aa  498  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  64.6 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  60.7 
 
 		 457 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  57.88 
 
 		 449 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  59.01 
 
 		 451 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  60.93 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  60.25 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  59.06 
 
 		 461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  54.74 
 
 		 488 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  53.05 
 
 		 515 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  53.45 
 
 		 410 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  56.3 
 
 		 462 aa  424  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  53.4 
 
 		 489 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  53.69 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  53.69 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  53.45 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  53.94 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  54.1 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  55.02 
 
 		 472 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  52.82 
 
 		 515 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  53.45 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  56.47 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  53.2 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  52.96 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  52.96 
 
 		 411 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  52.9 
 
 		 507 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  54.95 
 
 		 408 aa  413  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  52.11 
 
 		 485 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  54.95 
 
 		 408 aa  411  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  54.7 
 
 		 408 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  50.12 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  51.72 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  53.66 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  51.39 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  55.72 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  51.26 
 
 		 402 aa  395  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  51 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  52.84 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  52.44 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  50.99 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  51.76 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  53.94 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  52.68 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  52.44 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  52.2 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  50.48 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  51.82 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  53.33 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  50.25 
 
 		 444 aa  381  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  51.09 
 
 		 466 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  51.09 
 
 		 466 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  48.57 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  50.74 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  50.25 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  50 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  48.87 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  48.05 
 
 		 494 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  50 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  47.86 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  48.18 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  52.11 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  48.66 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  50 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  48.28 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  50.25 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  49.39 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  50.99 
 
 		 438 aa  368  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  47.82 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  52.75 
 
 		 454 aa  363  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  47.77 
 
 		 433 aa  363  3e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  47.75 
 
 		 443 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  49.52 
 
 		 459 aa  362  8e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  48.16 
 
 		 436 aa  362  9e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  48.85 
 
 		 515 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  46.35 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  47.68 
 
 		 500 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  47.68 
 
 		 466 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  47.68 
 
 		 500 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  47.68 
 
 		 466 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  47.68 
 
 		 466 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  49.51 
 
 		 427 aa  359  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  47.68 
 
 		 444 aa  359  5e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  47.68 
 
 		 478 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  49.26 
 
 		 429 aa  359  5e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  48.85 
 
 		 524 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  48.53 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  48.14 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  47.92 
 
 		 504 aa  356  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  47.43 
 
 		 469 aa  356  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  47.68 
 
 		 500 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  47.68 
 
 		 500 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  47.68 
 
 		 500 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3051  ammonium transporter  52.68 
 
 		 451 aa  355  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  47.91 
 
 		 477 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  47.68 
 
 		 500 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  50.63 
 
 		 457 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>