More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1490 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  100 
 
 		 472 aa  936    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  57.42 
 
 		 449 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  55.97 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  55.97 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  56 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  54.63 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  55.71 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  55.58 
 
 		 500 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  55.58 
 
 		 500 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  55.58 
 
 		 500 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  55.32 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  55.32 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  55.32 
 
 		 478 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  55.35 
 
 		 500 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  55.32 
 
 		 500 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  55.08 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  55.32 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  55.32 
 
 		 500 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  55.32 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  55.35 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  55.26 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  54.29 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  54.14 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  55.87 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  54.57 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  54.85 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  54.55 
 
 		 462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  53.08 
 
 		 457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  53.43 
 
 		 502 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  55.35 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  55.35 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  52.87 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  53.83 
 
 		 459 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  51.18 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  50.35 
 
 		 410 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  50.59 
 
 		 410 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  50.35 
 
 		 410 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  50.12 
 
 		 410 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  52.94 
 
 		 470 aa  392  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  55.5 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  48.39 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  52.38 
 
 		 405 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  50.12 
 
 		 410 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  50.12 
 
 		 410 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  50.72 
 
 		 410 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  49.88 
 
 		 410 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  53.83 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2476  ammonium transporter  51.15 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.796879  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  50.48 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  52.39 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  55.69 
 
 		 411 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  49.66 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  50.23 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  53.29 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  56.28 
 
 		 449 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  50.69 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  52.91 
 
 		 445 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  49.65 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  48.83 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  50 
 
 		 477 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  48.69 
 
 		 464 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  49.66 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  53.76 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  50.97 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  49.65 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  49.31 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  47.02 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  50.34 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  50.94 
 
 		 442 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  50.47 
 
 		 432 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  48.7 
 
 		 445 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  50.34 
 
 		 515 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  49.69 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  49.89 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  49.08 
 
 		 515 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  46.79 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  50.72 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  50.48 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  51.14 
 
 		 444 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  50.24 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  50.72 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  50.96 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  50.34 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  43.46 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  49.18 
 
 		 435 aa  365  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  48.86 
 
 		 524 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  48.34 
 
 		 432 aa  365  1e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  51.89 
 
 		 423 aa  363  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  46.71 
 
 		 498 aa  363  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  46.17 
 
 		 498 aa  363  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  46.44 
 
 		 498 aa  363  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  50 
 
 		 427 aa  363  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  50.47 
 
 		 442 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1270  ammonium transporter  53.2 
 
 		 461 aa  362  6e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  48.76 
 
 		 485 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  50.96 
 
 		 408 aa  362  1e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  48.92 
 
 		 480 aa  362  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  51.2 
 
 		 408 aa  361  1e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  52.63 
 
 		 401 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  51.2 
 
 		 408 aa  360  3e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>