More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_943 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  99.26 
 
 		 408 aa  790    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  100 
 
 		 408 aa  796    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  96.81 
 
 		 408 aa  735    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  58.02 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  61.48 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  59.35 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  59.27 
 
 		 451 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  56.44 
 
 		 457 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  57.43 
 
 		 449 aa  454  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  59.26 
 
 		 467 aa  451  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  56.82 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  59.6 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  56.36 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  55.22 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  52.44 
 
 		 410 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  53.09 
 
 		 411 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  52.68 
 
 		 410 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  56.82 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  57.53 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  52.2 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  52.68 
 
 		 410 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  54.21 
 
 		 405 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  52.93 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  52.44 
 
 		 410 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  52.44 
 
 		 410 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  52.2 
 
 		 410 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  53.33 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  55.94 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  58.72 
 
 		 464 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  51.74 
 
 		 399 aa  414  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  57.18 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  52.48 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  52.83 
 
 		 489 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  55.2 
 
 		 402 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  51.54 
 
 		 515 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  51.06 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  51.77 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  53.32 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  54.95 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  52.25 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  50.59 
 
 		 496 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  53.96 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  53.33 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  53.33 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  50.59 
 
 		 507 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  50.72 
 
 		 472 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2342  ammonium transporter  54.93 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.602093 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0157  hypothetical protein  50.12 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  54.09 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  51.73 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  51.59 
 
 		 470 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  52.22 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  51.23 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  52.23 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  49.88 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  49.63 
 
 		 427 aa  364  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  51.45 
 
 		 466 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  51.45 
 
 		 500 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  49.38 
 
 		 429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  51.45 
 
 		 500 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  51.45 
 
 		 466 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  51.45 
 
 		 466 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  51.45 
 
 		 444 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  51.45 
 
 		 478 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  51.69 
 
 		 504 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  51.21 
 
 		 469 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  53.22 
 
 		 454 aa  361  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  51.85 
 
 		 462 aa  361  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  48.21 
 
 		 463 aa  361  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  50.58 
 
 		 470 aa  361  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0771  ammonium transporter  49.25 
 
 		 396 aa  361  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00637331  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2464  ammonium transporter  53.81 
 
 		 456 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2376  ammonium transporter  53.56 
 
 		 456 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  46.55 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  48.51 
 
 		 453 aa  356  2.9999999999999997e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  51.97 
 
 		 397 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1491  ammonium transporter  53.07 
 
 		 456 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.936264  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1270  ammonium transporter  52.97 
 
 		 461 aa  356  3.9999999999999996e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  50 
 
 		 456 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  51.23 
 
 		 438 aa  355  6.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  51.21 
 
 		 500 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  49.51 
 
 		 431 aa  353  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  50.48 
 
 		 500 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  50.48 
 
 		 500 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  50.48 
 
 		 500 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  51.6 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  47.29 
 
 		 435 aa  352  5e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  50.49 
 
 		 431 aa  352  5e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  49.03 
 
 		 501 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  49.2 
 
 		 515 aa  349  6e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  48.97 
 
 		 436 aa  348  7e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  50.61 
 
 		 432 aa  348  7e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  48.8 
 
 		 439 aa  348  8e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  48.77 
 
 		 434 aa  348  9e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1698  ammonium transporter  45.8 
 
 		 521 aa  348  1e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.300416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  49.2 
 
 		 524 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  50.61 
 
 		 478 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2140  ammonium transporter  50.25 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  48.05 
 
 		 432 aa  346  3e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  48.92 
 
 		 474 aa  345  6e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>