More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0741 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  100 
 
 
397 aa  767    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  70.03 
 
 
397 aa  548  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  69.02 
 
 
400 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  65.91 
 
 
398 aa  524  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  66.75 
 
 
402 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  65.08 
 
 
402 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  61.52 
 
 
399 aa  482  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0771  ammonium transporter  64.1 
 
 
396 aa  475  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00637331  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0157  hypothetical protein  63.13 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  60.15 
 
 
398 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  55.08 
 
 
406 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  60.1 
 
 
408 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  54.66 
 
 
457 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  59.85 
 
 
408 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  59.6 
 
 
408 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  53.73 
 
 
449 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  54.09 
 
 
451 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  54.36 
 
 
405 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  54.09 
 
 
467 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  56.82 
 
 
464 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  54.34 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  55.22 
 
 
461 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  49.38 
 
 
410 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  49.63 
 
 
410 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  51.54 
 
 
489 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  51.88 
 
 
428 aa  385  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  50.95 
 
 
488 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  49.13 
 
 
410 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  49.63 
 
 
410 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  48.88 
 
 
411 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  53.28 
 
 
405 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  49.13 
 
 
410 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  49.38 
 
 
410 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  49.13 
 
 
410 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  48.89 
 
 
410 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  51.76 
 
 
402 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  50.87 
 
 
462 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  51.74 
 
 
438 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  48.81 
 
 
515 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  53.98 
 
 
411 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  51.74 
 
 
438 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  48.38 
 
 
429 aa  369  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  49.76 
 
 
485 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  48.33 
 
 
515 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  48.94 
 
 
496 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  51.76 
 
 
402 aa  363  3e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  50 
 
 
435 aa  363  3e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  52.39 
 
 
401 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  47.88 
 
 
507 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  48.88 
 
 
434 aa  358  6e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  50.25 
 
 
401 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  48.79 
 
 
469 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  49.14 
 
 
444 aa  353  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  48.54 
 
 
500 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  48.54 
 
 
444 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  48.54 
 
 
466 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  48.54 
 
 
478 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  48.54 
 
 
466 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  48.54 
 
 
500 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  47.89 
 
 
436 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  48.54 
 
 
466 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  50.74 
 
 
435 aa  352  7e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  45.64 
 
 
433 aa  352  7e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  48.64 
 
 
431 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  50.25 
 
 
438 aa  351  1e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  47.76 
 
 
431 aa  349  4e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  51.61 
 
 
470 aa  349  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1698  ammonium transporter  46.26 
 
 
521 aa  348  1e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.300416 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  48.48 
 
 
453 aa  348  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  47.33 
 
 
500 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  47.33 
 
 
500 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  47.33 
 
 
500 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  48.76 
 
 
432 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  47.09 
 
 
504 aa  346  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  47.33 
 
 
500 aa  346  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  50.38 
 
 
454 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  47.51 
 
 
463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  48.3 
 
 
502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  47.57 
 
 
499 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  46.9 
 
 
443 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  48.51 
 
 
433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  48.39 
 
 
436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  46.65 
 
 
411 aa  335  5.999999999999999e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  46.23 
 
 
439 aa  333  4e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  49.88 
 
 
433 aa  333  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  51.64 
 
 
423 aa  332  8e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  46.3 
 
 
494 aa  330  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  46.73 
 
 
427 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  45.39 
 
 
501 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  49.14 
 
 
456 aa  329  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  46.56 
 
 
459 aa  328  9e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  47.33 
 
 
503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  47.13 
 
 
472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  42.64 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  47.33 
 
 
497 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  45.97 
 
 
474 aa  326  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  48.61 
 
 
397 aa  325  7e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  50.12 
 
 
462 aa  325  7e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  47 
 
 
437 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  49.51 
 
 
439 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>