More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0541 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  100 
 
 		 462 aa  924    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  69.04 
 
 		 453 aa  607  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1347  ammonium transporter  67.05 
 
 		 442 aa  525  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2140  ammonium transporter  60.93 
 
 		 438 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0443  ammonium transporter  63.88 
 
 		 439 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06675  ammonium transporter  56.81 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3314  ammonium transporter  59.76 
 
 		 442 aa  463  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1337  ammonium transporter  56.32 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  52.58 
 
 		 467 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  49.26 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  49.88 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  48.73 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  48.22 
 
 		 457 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  51.46 
 
 		 408 aa  358  9e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  50.24 
 
 		 434 aa  358  9e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  51.71 
 
 		 408 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  51.85 
 
 		 408 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  48.16 
 
 		 405 aa  356  5e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  46.22 
 
 		 451 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  46.31 
 
 		 410 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  46.29 
 
 		 410 aa  349  6e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  46.29 
 
 		 410 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  46.29 
 
 		 410 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  46.31 
 
 		 411 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  48.04 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  46.04 
 
 		 410 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  47.46 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  46.29 
 
 		 410 aa  346  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  46.04 
 
 		 410 aa  346  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  45.79 
 
 		 410 aa  345  8e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  46.93 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  46.85 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  47.27 
 
 		 504 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  46.24 
 
 		 470 aa  340  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  45.39 
 
 		 438 aa  341  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  45.39 
 
 		 438 aa  341  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  46.56 
 
 		 466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  46.56 
 
 		 500 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  46.9 
 
 		 500 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  46.9 
 
 		 500 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  46.9 
 
 		 500 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  46.56 
 
 		 466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  46.56 
 
 		 500 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  46.56 
 
 		 466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  46.56 
 
 		 444 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  46.56 
 
 		 478 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  46.67 
 
 		 500 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  47.15 
 
 		 402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  46.56 
 
 		 469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  46.7 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  46.12 
 
 		 453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  50.37 
 
 		 397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2342  ammonium transporter  47.65 
 
 		 455 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.602093 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  47.24 
 
 		 431 aa  335  7e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  46.49 
 
 		 431 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  44.12 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  46.52 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  45.92 
 
 		 485 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  47.04 
 
 		 397 aa  334  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  45.13 
 
 		 463 aa  331  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  44.96 
 
 		 515 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  45.2 
 
 		 515 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  48.26 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  47.62 
 
 		 405 aa  329  8e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  45.01 
 
 		 462 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  46.19 
 
 		 502 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  46.02 
 
 		 411 aa  325  9e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  41.79 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  46.17 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  49.13 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  45.84 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  45.67 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  47.03 
 
 		 503 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  47.03 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  43.35 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  45.48 
 
 		 444 aa  323  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  45.78 
 
 		 431 aa  323  6e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  45.43 
 
 		 428 aa  322  7e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  48.63 
 
 		 464 aa  322  9.000000000000001e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  45.81 
 
 		 398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  48.03 
 
 		 454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  43.33 
 
 		 501 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  44.73 
 
 		 499 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  45.24 
 
 		 496 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  44.47 
 
 		 507 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1679  ammonia permease  44.17 
 
 		 448 aa  316  4e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  45.79 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  44.63 
 
 		 459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  47.73 
 
 		 413 aa  314  2.9999999999999996e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  45.5 
 
 		 445 aa  313  5.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  45.37 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  44.8 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  45.83 
 
 		 434 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  43.55 
 
 		 435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1491  ammonium transporter  44.88 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.936264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  45.69 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  45.23 
 
 		 431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  44.67 
 
 		 466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  44.24 
 
 		 474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  45.48 
 
 		 437 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>