More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1785 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  100 
 
 
439 aa  850    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  75.71 
 
 
439 aa  586  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  68.12 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  59.57 
 
 
446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  55.97 
 
 
439 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  58.31 
 
 
456 aa  438  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  55.97 
 
 
474 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  58.8 
 
 
478 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  55.68 
 
 
466 aa  431  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  55.84 
 
 
432 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  57.31 
 
 
456 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  56.26 
 
 
434 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  55.17 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  57.79 
 
 
445 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  53.44 
 
 
465 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  54.22 
 
 
449 aa  408  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  53.9 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  52.63 
 
 
442 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  52.5 
 
 
435 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  56.59 
 
 
438 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  55.3 
 
 
447 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  51.96 
 
 
438 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  51.58 
 
 
450 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  51.82 
 
 
446 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  54.11 
 
 
429 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  51.82 
 
 
446 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  51.82 
 
 
446 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  54.98 
 
 
424 aa  391  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  49.54 
 
 
427 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  51.57 
 
 
434 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  51.92 
 
 
450 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  52.48 
 
 
440 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  54.71 
 
 
477 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  53.49 
 
 
450 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  52.53 
 
 
451 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  51.7 
 
 
444 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  50.48 
 
 
467 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  49.76 
 
 
457 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  49.01 
 
 
405 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  49.03 
 
 
434 aa  364  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  50.98 
 
 
398 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  48.99 
 
 
450 aa  361  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  50 
 
 
463 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  50 
 
 
405 aa  361  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  48.84 
 
 
489 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  49.15 
 
 
402 aa  360  3e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  50.7 
 
 
417 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  51.83 
 
 
435 aa  359  5e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  50.36 
 
 
501 aa  359  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  50.48 
 
 
433 aa  358  8e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  47.32 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  51.9 
 
 
499 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  49.51 
 
 
451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  52.38 
 
 
502 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  48.23 
 
 
432 aa  354  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  50.83 
 
 
504 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  50.12 
 
 
444 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  50.12 
 
 
478 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  48.27 
 
 
488 aa  352  7e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  50.12 
 
 
500 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  48.92 
 
 
457 aa  352  8e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  50.12 
 
 
466 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  50.24 
 
 
431 aa  352  8e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  50.12 
 
 
500 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  50.12 
 
 
466 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  50.12 
 
 
466 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  51.82 
 
 
438 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  51.82 
 
 
438 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  50.48 
 
 
429 aa  351  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  50.48 
 
 
469 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  50.86 
 
 
464 aa  352  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  54.07 
 
 
441 aa  350  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  48.3 
 
 
462 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  49.52 
 
 
443 aa  350  4e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  48.56 
 
 
436 aa  349  6e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  47.4 
 
 
494 aa  349  7e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  50.12 
 
 
500 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  50.12 
 
 
500 aa  348  8e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  50.12 
 
 
500 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  50.12 
 
 
500 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  49.42 
 
 
507 aa  348  8e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  50 
 
 
428 aa  348  9e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  48.83 
 
 
485 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  48.82 
 
 
429 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  46.46 
 
 
437 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  50.47 
 
 
431 aa  347  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  46.93 
 
 
437 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  46.46 
 
 
437 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  50.6 
 
 
438 aa  347  2e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  51.05 
 
 
442 aa  346  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  47.71 
 
 
461 aa  346  5e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  48.61 
 
 
496 aa  345  7e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  46.23 
 
 
437 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  47.31 
 
 
515 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  49.51 
 
 
397 aa  344  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  47.18 
 
 
515 aa  343  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  51.21 
 
 
423 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  50.24 
 
 
431 aa  343  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  51.21 
 
 
433 aa  342  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  45.75 
 
 
466 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>