More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1298 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  100 
 
 		 456 aa  883    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  92.81 
 
 		 478 aa  774    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  53.93 
 
 		 466 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  56.13 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  54.75 
 
 		 465 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  53.4 
 
 		 474 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  61.99 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  60.05 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  57.04 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  56.24 
 
 		 456 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  52.87 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  53 
 
 		 434 aa  421  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  53.33 
 
 		 439 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  58.31 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  52.09 
 
 		 438 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  56.73 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  52.8 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  58.88 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  53.3 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  56.04 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  53.3 
 
 		 440 aa  401  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  50.57 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  50 
 
 		 435 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  51.44 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  52.43 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  53.33 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  55.12 
 
 		 445 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  52.72 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  53.18 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  51.72 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  49.66 
 
 		 446 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  49.66 
 
 		 446 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  49.66 
 
 		 446 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  50.22 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  48.78 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  49.77 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  49.76 
 
 		 457 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  52.47 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  52.64 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  47.43 
 
 		 488 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  47.79 
 
 		 489 aa  364  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  51.33 
 
 		 464 aa  363  5.0000000000000005e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  50 
 
 		 467 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  53.55 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  53.55 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  49.67 
 
 		 450 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  53.55 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  48.8 
 
 		 451 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  47.06 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  48.91 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  46.73 
 
 		 485 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  48.2 
 
 		 461 aa  354  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  46.73 
 
 		 515 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  50.24 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  49.76 
 
 		 423 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  46.26 
 
 		 515 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  46.05 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  46.54 
 
 		 507 aa  349  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  45.99 
 
 		 451 aa  349  7e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  47.48 
 
 		 429 aa  349  7e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  48.18 
 
 		 444 aa  348  8e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  48.04 
 
 		 405 aa  346  4e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  47.93 
 
 		 434 aa  346  5e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  50.61 
 
 		 443 aa  346  6e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  45.03 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  49.77 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  47.51 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  48.6 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  48.78 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  49.88 
 
 		 408 aa  343  5e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  49.63 
 
 		 408 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  49.88 
 
 		 408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  46.15 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  46.9 
 
 		 431 aa  339  5e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  47.12 
 
 		 436 aa  339  7e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  44.95 
 
 		 410 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  46.17 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  47.12 
 
 		 461 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  45.89 
 
 		 411 aa  335  9e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  49.39 
 
 		 433 aa  335  9e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  49.14 
 
 		 397 aa  334  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  45.43 
 
 		 410 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  46.19 
 
 		 463 aa  333  4e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  50.12 
 
 		 401 aa  333  5e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  49.63 
 
 		 402 aa  332  6e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  46.15 
 
 		 472 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  44.71 
 
 		 410 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  45.43 
 
 		 410 aa  332  8e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  45.43 
 
 		 410 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  45.19 
 
 		 410 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  45.19 
 
 		 410 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  45.65 
 
 		 410 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  46.44 
 
 		 402 aa  331  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  49.26 
 
 		 402 aa  330  4e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  44.47 
 
 		 453 aa  329  5.0000000000000004e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  47.6 
 
 		 438 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  45.05 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  45.19 
 
 		 398 aa  327  3e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  46.01 
 
 		 494 aa  326  5e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  45.15 
 
 		 441 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>