More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3149 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  100 
 
 
459 aa  907    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  62.02 
 
 
441 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  62.7 
 
 
434 aa  511  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  60.54 
 
 
435 aa  498  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  60.05 
 
 
438 aa  495  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  61.78 
 
 
474 aa  495  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  59.86 
 
 
424 aa  478  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  57.73 
 
 
446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  57.73 
 
 
446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  57.73 
 
 
446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  54.63 
 
 
442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  55.09 
 
 
450 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  56.37 
 
 
450 aa  445  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  56.19 
 
 
450 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  55.48 
 
 
456 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  58.28 
 
 
447 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  59.67 
 
 
445 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  55.01 
 
 
450 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  53.1 
 
 
478 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  52.87 
 
 
456 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  54.55 
 
 
451 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  53.1 
 
 
431 aa  409  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  53.59 
 
 
432 aa  411  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  54.02 
 
 
440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  56.03 
 
 
477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  57.4 
 
 
441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  53.23 
 
 
465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  51.88 
 
 
466 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  50.45 
 
 
457 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  56.25 
 
 
439 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  49.66 
 
 
439 aa  385  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  54.65 
 
 
433 aa  385  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  52.53 
 
 
439 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  51.74 
 
 
443 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  50.46 
 
 
417 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  49.45 
 
 
446 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  50.47 
 
 
429 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  47.05 
 
 
427 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  52.19 
 
 
438 aa  365  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  50.69 
 
 
442 aa  356  5.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  47.8 
 
 
429 aa  354  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  48.16 
 
 
434 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  49.31 
 
 
449 aa  349  6e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  49.89 
 
 
429 aa  346  6e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  48.15 
 
 
431 aa  344  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  50.23 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  50.23 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  50.23 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  52.53 
 
 
420 aa  343  5e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  48.13 
 
 
444 aa  341  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  47.33 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  49.08 
 
 
417 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  47.05 
 
 
438 aa  336  5e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  48.72 
 
 
435 aa  335  9e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  45.03 
 
 
433 aa  334  2e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  46.95 
 
 
501 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  43.55 
 
 
457 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  45.54 
 
 
405 aa  331  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  46.21 
 
 
451 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  48.41 
 
 
500 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  48.41 
 
 
504 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  45.75 
 
 
467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  47.95 
 
 
500 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  47.95 
 
 
500 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  47.95 
 
 
500 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  44.74 
 
 
494 aa  323  5e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  47.5 
 
 
469 aa  322  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  46.82 
 
 
500 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  46.82 
 
 
444 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  46.82 
 
 
466 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  46.82 
 
 
478 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  46.82 
 
 
466 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  46.82 
 
 
466 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  46.82 
 
 
500 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  45.96 
 
 
438 aa  319  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  45.96 
 
 
438 aa  319  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  43.65 
 
 
410 aa  318  9e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  44.87 
 
 
489 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  44.14 
 
 
411 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  45.07 
 
 
405 aa  318  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  46.82 
 
 
502 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  43.95 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  45.35 
 
 
453 aa  315  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  44.52 
 
 
515 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  43.36 
 
 
398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  44.19 
 
 
410 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  43.95 
 
 
488 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  44.07 
 
 
515 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  43.85 
 
 
485 aa  312  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  43.42 
 
 
436 aa  312  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2526  ammonium transporter  45.5 
 
 
424 aa  312  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  45.2 
 
 
461 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  43.95 
 
 
410 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  43.95 
 
 
410 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  44.96 
 
 
496 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  43.42 
 
 
410 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  42.72 
 
 
397 aa  312  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  46.24 
 
 
464 aa  311  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  43.49 
 
 
410 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  44.95 
 
 
472 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>