More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2232 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  100 
 
 		 451 aa  882    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  88.91 
 
 		 450 aa  771    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  68.39 
 
 		 457 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  70.62 
 
 		 443 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  56.54 
 
 		 474 aa  477  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  59.39 
 
 		 441 aa  460  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  65.6 
 
 		 420 aa  455  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  59.81 
 
 		 442 aa  451  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  60 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  59.13 
 
 		 434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  60.34 
 
 		 424 aa  448  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  59.57 
 
 		 438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  58.2 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  58.2 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  58.2 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  57.69 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  56.64 
 
 		 459 aa  428  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  58.54 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  54.27 
 
 		 456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  53.48 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  53.81 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  54.15 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  53.56 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  49.05 
 
 		 466 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  52.94 
 
 		 440 aa  378  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  54.76 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  53.98 
 
 		 431 aa  375  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  53.3 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  49.54 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  56.39 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  53.64 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  54.37 
 
 		 439 aa  364  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  54.85 
 
 		 441 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  51.08 
 
 		 478 aa  354  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  50.84 
 
 		 456 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  49.03 
 
 		 427 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  48.43 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  53.98 
 
 		 439 aa  343  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  49.4 
 
 		 442 aa  340  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  49.12 
 
 		 417 aa  331  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  50.97 
 
 		 438 aa  326  6e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  50.75 
 
 		 417 aa  316  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  49.62 
 
 		 417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  49.62 
 
 		 417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  49.62 
 
 		 417 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  46.06 
 
 		 429 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  46.75 
 
 		 449 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  44.74 
 
 		 405 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  46.75 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  47.2 
 
 		 429 aa  299  7e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  45.34 
 
 		 405 aa  298  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  45.19 
 
 		 453 aa  297  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  43.91 
 
 		 515 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  43.42 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  45.89 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  44.02 
 
 		 410 aa  294  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  44.14 
 
 		 488 aa  293  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  46.49 
 
 		 451 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  44.02 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  46.77 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  43.19 
 
 		 515 aa  289  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  43.78 
 
 		 410 aa  289  8e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  44.31 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  44.2 
 
 		 410 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  45.3 
 
 		 455 aa  288  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  44.53 
 
 		 461 aa  287  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  44.9 
 
 		 428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0487  ammonium transporter  44.15 
 
 		 428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0378  ammonium transporter  44.15 
 
 		 428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  43.48 
 
 		 410 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  43.96 
 
 		 410 aa  286  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  44.82 
 
 		 467 aa  286  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  43.91 
 
 		 428 aa  285  9e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0540  ammonium transporter  43.91 
 
 		 428 aa  285  9e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  43.91 
 
 		 428 aa  285  9e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0495  ammonium transporter  43.91 
 
 		 428 aa  285  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3164  ammonium transporter  43.91 
 
 		 428 aa  285  9e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00403  ammonium transporter  43.91 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  46.12 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  43.72 
 
 		 410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00407  hypothetical protein  43.91 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  43.82 
 
 		 494 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  43.24 
 
 		 410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04231  hypothetical protein  43.1 
 
 		 449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  45.82 
 
 		 445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  43.32 
 
 		 485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  44.01 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  43.77 
 
 		 428 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  43.61 
 
 		 496 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  43.77 
 
 		 428 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  45.93 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  43.51 
 
 		 462 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0513  ammonium transporter  43.77 
 
 		 428 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  43.65 
 
 		 449 aa  280  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  44.74 
 
 		 438 aa  280  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  44.74 
 
 		 438 aa  280  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0566  ammonium transporter  43.77 
 
 		 428 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.887749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  45.1 
 
 		 464 aa  279  6e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  42.4 
 
 		 489 aa  279  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  41.59 
 
 		 402 aa  279  8e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>