More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3244 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  100 
 
 		 457 aa  904    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  79.91 
 
 		 443 aa  658    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  68.39 
 
 		 451 aa  561  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  66.52 
 
 		 450 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  52.88 
 
 		 474 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  57.52 
 
 		 435 aa  441  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  56.35 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  61.2 
 
 		 420 aa  432  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  56.09 
 
 		 441 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  55.16 
 
 		 442 aa  425  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  54.46 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  54.23 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  51.83 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  51.83 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  51.83 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  52.05 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  51.63 
 
 		 450 aa  398  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  51.86 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  51.93 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  50.11 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  49 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  45.53 
 
 		 466 aa  359  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  52.01 
 
 		 456 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  53.37 
 
 		 433 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  49.01 
 
 		 432 aa  352  8e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  46.88 
 
 		 465 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  52.14 
 
 		 445 aa  350  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  50.12 
 
 		 478 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  51.79 
 
 		 439 aa  350  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  50.12 
 
 		 456 aa  349  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  47.14 
 
 		 431 aa  346  6e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  51.57 
 
 		 447 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  45.47 
 
 		 477 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  49.76 
 
 		 441 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  48.8 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  48.65 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  48.92 
 
 		 439 aa  326  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  46.1 
 
 		 429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  44.39 
 
 		 427 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  46.4 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  47.09 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  46.06 
 
 		 405 aa  302  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  46.48 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  46.23 
 
 		 449 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  44.5 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  45.97 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  44.26 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  45.43 
 
 		 488 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  43.82 
 
 		 485 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  44.86 
 
 		 489 aa  292  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  43.59 
 
 		 464 aa  292  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  43.66 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  43.22 
 
 		 515 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  43.38 
 
 		 457 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  43.43 
 
 		 476 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  43.73 
 
 		 405 aa  289  8e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  42.99 
 
 		 515 aa  286  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  42.28 
 
 		 410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  44.36 
 
 		 462 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  47.37 
 
 		 417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  47.37 
 
 		 417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  47.37 
 
 		 417 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  46.88 
 
 		 417 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  42.12 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  43.95 
 
 		 397 aa  282  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  42.42 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  43.75 
 
 		 496 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  42.18 
 
 		 410 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  42.34 
 
 		 428 aa  279  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  42.18 
 
 		 410 aa  279  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  42.65 
 
 		 410 aa  279  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  42.86 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  42.86 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  41.94 
 
 		 410 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  40.4 
 
 		 480 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  44.06 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04231  hypothetical protein  41.16 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  43.52 
 
 		 507 aa  277  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  41.73 
 
 		 453 aa  276  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  41.71 
 
 		 410 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2710  ammonium transporter  41 
 
 		 402 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  39.6 
 
 		 500 aa  276  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  43.9 
 
 		 472 aa  276  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  41.71 
 
 		 410 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  43.73 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0378  ammonium transporter  41.85 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  42.58 
 
 		 455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  40.04 
 
 		 500 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  41.61 
 
 		 428 aa  273  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0540  ammonium transporter  41.61 
 
 		 428 aa  273  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3164  ammonium transporter  41.61 
 
 		 428 aa  273  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0495  ammonium transporter  41.61 
 
 		 428 aa  273  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  41.61 
 
 		 428 aa  273  6e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00403  ammonium transporter  41.61 
 
 		 428 aa  272  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00407  hypothetical protein  41.61 
 
 		 428 aa  272  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  40.78 
 
 		 461 aa  272  7e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  41.22 
 
 		 494 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  41.51 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0487  ammonium transporter  41.61 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  41.91 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>