More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4891 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  89.45 
 
 
417 aa  717    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  99.76 
 
 
417 aa  815    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  100 
 
 
417 aa  818    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  100 
 
 
417 aa  818    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  89.21 
 
 
417 aa  697    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  63.37 
 
 
440 aa  487  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  60.14 
 
 
456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  60.38 
 
 
447 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  55.69 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  60.58 
 
 
445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  54.66 
 
 
442 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  51.73 
 
 
466 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  53.92 
 
 
478 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  53.44 
 
 
456 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  49.77 
 
 
459 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  50.46 
 
 
465 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  50.12 
 
 
474 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  49.77 
 
 
441 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  53 
 
 
477 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  50.35 
 
 
435 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  49.88 
 
 
432 aa  363  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  48.47 
 
 
439 aa  362  8e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  49.88 
 
 
446 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  49.76 
 
 
429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  48.56 
 
 
427 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  48.33 
 
 
434 aa  350  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  50.24 
 
 
424 aa  348  9e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  48.37 
 
 
438 aa  348  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  47.27 
 
 
446 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  47.27 
 
 
446 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  47.27 
 
 
446 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  48.28 
 
 
442 aa  340  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  53.85 
 
 
438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  47.62 
 
 
450 aa  340  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  50.71 
 
 
439 aa  338  8e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  51.54 
 
 
439 aa  332  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  47.36 
 
 
449 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  50.13 
 
 
450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  46.04 
 
 
405 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  47.2 
 
 
450 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  44.74 
 
 
405 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  44.26 
 
 
411 aa  319  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  47.74 
 
 
450 aa  318  9e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  43.54 
 
 
410 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  43.78 
 
 
410 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  43.78 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  43.78 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  43.78 
 
 
410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  45.8 
 
 
467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  43.54 
 
 
410 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  51.44 
 
 
433 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  43.54 
 
 
410 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  49.38 
 
 
451 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  43.17 
 
 
410 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  44.6 
 
 
434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  42.99 
 
 
489 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  44.44 
 
 
401 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  43.78 
 
 
515 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  43.55 
 
 
515 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  45.65 
 
 
443 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4808  ammonium transporter  43.03 
 
 
456 aa  299  6e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  44.36 
 
 
451 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  46.83 
 
 
464 aa  298  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2251  ammonium transporter  46.34 
 
 
434 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.163851 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  46.38 
 
 
402 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  43.69 
 
 
398 aa  297  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  47.13 
 
 
457 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  44.52 
 
 
461 aa  296  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  44.89 
 
 
462 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  43.09 
 
 
485 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  43.09 
 
 
488 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  45.52 
 
 
423 aa  293  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  46.14 
 
 
401 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  48.13 
 
 
441 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2710  ammonium transporter  42.48 
 
 
402 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  41.3 
 
 
457 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  42.24 
 
 
431 aa  289  6e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  46.5 
 
 
431 aa  289  7e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  43.61 
 
 
496 aa  286  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  42.75 
 
 
431 aa  286  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  41.59 
 
 
402 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  42.04 
 
 
434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2057  ammonium transporter  43.83 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00112408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  43.38 
 
 
507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  40.53 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  41.75 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  43.27 
 
 
438 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  43.27 
 
 
438 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  42.33 
 
 
476 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  42.02 
 
 
449 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  42.02 
 
 
441 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  42.65 
 
 
469 aa  279  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  43.34 
 
 
433 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  39.81 
 
 
406 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  42.17 
 
 
463 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  42.28 
 
 
444 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  42.28 
 
 
500 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  43.27 
 
 
408 aa  278  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  42.28 
 
 
466 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  42.28 
 
 
500 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>