More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2251 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2251  ammonium transporter  100 
 
 		 434 aa  852    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  67.67 
 
 		 441 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  69.14 
 
 		 441 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  64.62 
 
 		 438 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  61.81 
 
 		 442 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  61.81 
 
 		 442 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  59.48 
 
 		 445 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  61.29 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  59.03 
 
 		 444 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  61 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  60.87 
 
 		 443 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  61.11 
 
 		 443 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  61.11 
 
 		 443 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  55.16 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  54.13 
 
 		 434 aa  435  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  53.83 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  52.45 
 
 		 444 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  52.68 
 
 		 438 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  52.68 
 
 		 438 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  51.78 
 
 		 461 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  52.52 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  52.52 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  52.29 
 
 		 437 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  52.29 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  52.96 
 
 		 500 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  52.96 
 
 		 444 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  52.96 
 
 		 500 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  52.96 
 
 		 478 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  53.05 
 
 		 504 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  52.96 
 
 		 466 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  53.12 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  53.19 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  52.96 
 
 		 466 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  52.96 
 
 		 466 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  52.48 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  51.02 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  52.48 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  52.48 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  52.48 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  51.33 
 
 		 501 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  54.22 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  51.3 
 
 		 499 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  45.89 
 
 		 500 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  52.21 
 
 		 433 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  50.23 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  50.23 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  45.99 
 
 		 498 aa  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  50.46 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  51.77 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  45.67 
 
 		 500 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  49.32 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  46.2 
 
 		 498 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  46.2 
 
 		 498 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  52.48 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  52.48 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  49.67 
 
 		 480 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  44.37 
 
 		 499 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  50.12 
 
 		 463 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  49.65 
 
 		 431 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  52.64 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  46.9 
 
 		 476 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  47.25 
 
 		 477 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  51.31 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  47.29 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  52.66 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  48.56 
 
 		 432 aa  378  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  46.05 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  51.67 
 
 		 468 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  43.44 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  47.67 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  46.5 
 
 		 510 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  48.27 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  46.38 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  47.17 
 
 		 499 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  49.04 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  50.49 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  51.19 
 
 		 467 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  47.24 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  44.83 
 
 		 480 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  43.17 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  48.68 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  45.48 
 
 		 515 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  45.48 
 
 		 524 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  46.44 
 
 		 428 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  46.67 
 
 		 428 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  47.95 
 
 		 472 aa  360  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  46.67 
 
 		 428 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0513  ammonium transporter  46.67 
 
 		 428 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0566  ammonium transporter  46.67 
 
 		 428 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.887749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  48.92 
 
 		 454 aa  359  6e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0272  ammonium transporter  45.01 
 
 		 480 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2327  ammonium transporter  46.7 
 
 		 489 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.414332  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0278  ammonium transporter  45.04 
 
 		 480 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  49.16 
 
 		 449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2170  ammonium transporter  46.65 
 
 		 512 aa  356  5e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246241  normal  0.111123 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2734  ammonium transporter  46.23 
 
 		 509 aa  356  5e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1088  ammonium transporter  50.12 
 
 		 484 aa  355  5.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.149046  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  47.72 
 
 		 451 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  46.82 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0593  ammonium transporter  51.69 
 
 		 440 aa  352  5e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>