More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0807 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  88.43 
 
 		 437 aa  757    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  85.48 
 
 		 432 aa  726    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  89.35 
 
 		 437 aa  764    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  88.66 
 
 		 437 aa  760    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  97.21 
 
 		 466 aa  892    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  100 
 
 		 466 aa  918    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  88.89 
 
 		 437 aa  761    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  95.71 
 
 		 466 aa  880    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  71.83 
 
 		 445 aa  619  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  66.99 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  61.87 
 
 		 436 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  57.35 
 
 		 436 aa  448  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  53.13 
 
 		 444 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  55.09 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  54.68 
 
 		 438 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  55.48 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  54.68 
 
 		 438 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  55.06 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  52.2 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  52.62 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  52.62 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  52.62 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  53.64 
 
 		 435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  53.1 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  53.1 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0490  ammonium transporter  48.93 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.641765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  53.1 
 
 		 444 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  53.1 
 
 		 478 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  52.86 
 
 		 504 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  52.14 
 
 		 500 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  52.62 
 
 		 469 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  53.1 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  53.1 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  53.1 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  51.36 
 
 		 434 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  50.56 
 
 		 441 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  51.43 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  51.9 
 
 		 502 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  52.14 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  54.99 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  50.12 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  54.76 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  55.51 
 
 		 445 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  56.6 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2232  ammonium transporter  51.08 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0268  ammonium transporter  47.82 
 
 		 431 aa  388  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  49.29 
 
 		 501 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  54.14 
 
 		 444 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  50.48 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  52.38 
 
 		 503 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  52.38 
 
 		 497 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  54.28 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  50.71 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  50.34 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  54.05 
 
 		 443 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  51.68 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  54.28 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  50.49 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  51.34 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  47.94 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  51.52 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  50 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  48.49 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  50.35 
 
 		 467 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2251  ammonium transporter  51.2 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  50.48 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  48.56 
 
 		 428 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32601  Amt family transporter: ammonium  51.33 
 
 		 530 aa  365  1e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000576108  normal  0.0348473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  54.19 
 
 		 449 aa  363  3e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  48.71 
 
 		 477 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  47.56 
 
 		 515 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  47.92 
 
 		 513 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2309  ammonium transporter  49.14 
 
 		 437 aa  362  6e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  47.56 
 
 		 524 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0178  ammonium transporter  48.32 
 
 		 482 aa  360  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  49.15 
 
 		 430 aa  360  4e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  49.17 
 
 		 472 aa  359  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  48.91 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  47.76 
 
 		 476 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  52.32 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  45.05 
 
 		 480 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  46.99 
 
 		 510 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  48.46 
 
 		 434 aa  355  5.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  46.14 
 
 		 432 aa  355  8.999999999999999e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  49.75 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.447574 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  49.75 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  49.75 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  48.15 
 
 		 429 aa  355  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  49.4 
 
 		 449 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1110  ammonium transporter  51.09 
 
 		 428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0348758  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  48.09 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  50.72 
 
 		 461 aa  353  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  48.17 
 
 		 452 aa  353  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  48.25 
 
 		 451 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  44.2 
 
 		 499 aa  352  8e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0272  ammonium transporter  44.56 
 
 		 480 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  48.67 
 
 		 454 aa  349  5e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  47.79 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2331  ammonium transporter  47.95 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  43.93 
 
 		 500 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>