More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5294 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  97.74 
 
 		 443 aa  778    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  88.76 
 
 		 445 aa  729    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  89.23 
 
 		 445 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  89.89 
 
 		 445 aa  768    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  97.52 
 
 		 444 aa  796    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  86.46 
 
 		 442 aa  702    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  100 
 
 		 443 aa  876    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  87.13 
 
 		 442 aa  706    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  97.74 
 
 		 443 aa  778    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  79.68 
 
 		 438 aa  668    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  64.66 
 
 		 441 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  65.58 
 
 		 436 aa  546  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  64.34 
 
 		 441 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  66.03 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  66.03 
 
 		 444 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  66.03 
 
 		 478 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  65.8 
 
 		 469 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  66.03 
 
 		 500 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  66.03 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  66.03 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  66.03 
 
 		 500 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  64.37 
 
 		 500 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  63.9 
 
 		 500 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  63.9 
 
 		 504 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  64.37 
 
 		 500 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  64.37 
 
 		 500 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  62.7 
 
 		 438 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  62.71 
 
 		 501 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  62.7 
 
 		 438 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  61.1 
 
 		 444 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  61.93 
 
 		 435 aa  492  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  64.13 
 
 		 503 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  61.58 
 
 		 431 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  64.13 
 
 		 497 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  63.66 
 
 		 502 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  62.71 
 
 		 499 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2251  ammonium transporter  60.87 
 
 		 434 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  62.19 
 
 		 433 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  57.79 
 
 		 434 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  54.59 
 
 		 494 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  52.92 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  54.08 
 
 		 498 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  54.01 
 
 		 498 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  55.21 
 
 		 461 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  55.68 
 
 		 431 aa  455  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  52.48 
 
 		 500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  53.36 
 
 		 498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  56.91 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  51.62 
 
 		 499 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  54.07 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  54.9 
 
 		 445 aa  448  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  61.38 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  50.64 
 
 		 506 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  50.31 
 
 		 480 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  52.94 
 
 		 515 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  54.61 
 
 		 433 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  52.81 
 
 		 524 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  54.19 
 
 		 437 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  53.5 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  54.27 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  54.19 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  54.19 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  53.27 
 
 		 510 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  57.83 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  54.25 
 
 		 477 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  54.04 
 
 		 466 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  54.04 
 
 		 466 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  53.95 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  53.59 
 
 		 466 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  54.25 
 
 		 476 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  55.56 
 
 		 480 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  52.67 
 
 		 504 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  55.4 
 
 		 452 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  54.42 
 
 		 499 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  57.24 
 
 		 468 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0272  ammonium transporter  51.39 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  63.92 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  49.57 
 
 		 500 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  53.6 
 
 		 451 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0278  ammonium transporter  50.1 
 
 		 480 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  52.14 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0373  ammonium transporter  52.8 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0694  ammonium transporter  54.2 
 
 		 452 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  58.03 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0184  ammonium transporter  53.56 
 
 		 515 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  55.61 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  51.93 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  53.81 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  51.92 
 
 		 432 aa  412  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  55.48 
 
 		 466 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  52.75 
 
 		 436 aa  415  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  51.93 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  54.78 
 
 		 449 aa  411  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2734  ammonium transporter  49.39 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0172  putative ammonium transporter transmembrane protein  52.89 
 
 		 508 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17564  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  52.46 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  54.52 
 
 		 467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2032  ammonium transporter  54.85 
 
 		 482 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.482356  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0473  ammonium transporter  52.77 
 
 		 522 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  55.88 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>