More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1061 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00403  ammonium transporter  76.11 
 
 		 428 aa  661    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  76.35 
 
 		 428 aa  662    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  84.85 
 
 		 430 aa  709    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  76.58 
 
 		 428 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1110  ammonium transporter  82.48 
 
 		 428 aa  687    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0348758  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00407  hypothetical protein  76.11 
 
 		 428 aa  661    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  76.81 
 
 		 428 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  99.07 
 
 		 430 aa  838    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0378  ammonium transporter  75.88 
 
 		 428 aa  656    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3056  ammonium transporter  83.72 
 
 		 430 aa  702    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  76.35 
 
 		 428 aa  662    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0540  ammonium transporter  76.35 
 
 		 428 aa  662    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0495  ammonium transporter  76.35 
 
 		 428 aa  662    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3164  ammonium transporter  76.35 
 
 		 428 aa  662    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  84.85 
 
 		 430 aa  709    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.447574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  79.63 
 
 		 428 aa  677    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2864  ammonium transporter  83.49 
 
 		 430 aa  697    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.962346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0487  ammonium transporter  76.11 
 
 		 428 aa  660    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  84.85 
 
 		 430 aa  709    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0513  ammonium transporter  76.81 
 
 		 428 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0566  ammonium transporter  76.81 
 
 		 428 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.887749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  100 
 
 		 428 aa  844    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  76.81 
 
 		 428 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  56.68 
 
 		 436 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  56.58 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  55.02 
 
 		 524 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  60.6 
 
 		 457 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  55.48 
 
 		 494 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  55.2 
 
 		 510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  54.84 
 
 		 515 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  56.72 
 
 		 434 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0184  ammonium transporter  56.43 
 
 		 515 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  54.85 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  54.73 
 
 		 499 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0473  ammonium transporter  57.11 
 
 		 522 aa  455  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1088  ammonium transporter  58.02 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.149046  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1122  ammonium transporter  58.74 
 
 		 483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.909008  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  53.75 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0121  ammonium transporter  55.98 
 
 		 521 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0596893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0172  putative ammonium transporter transmembrane protein  55.88 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17564  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  58.82 
 
 		 480 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  58.35 
 
 		 468 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0219  ammonium transporter  56.94 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0164  ammonium transporter  61.33 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.611454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0182  ammonium transporter  61.33 
 
 		 473 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0599171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0111  ammonium transporter  60.74 
 
 		 476 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0168687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0593  ammonium transporter  59.61 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  52.44 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3313  ammonium transporter  54.85 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  0.097706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  52.95 
 
 		 480 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  54.03 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  53.83 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  53.16 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  53.16 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  53.16 
 
 		 478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  53.16 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  53.16 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  53.16 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  53.16 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3051  ammonium transporter  54.85 
 
 		 451 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  50.12 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  52.43 
 
 		 469 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  50 
 
 		 480 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  47.38 
 
 		 500 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  46.57 
 
 		 506 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  52.08 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  52.18 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  50.47 
 
 		 477 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  51.46 
 
 		 500 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  51.46 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  51.46 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  52.08 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  51.46 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  51.21 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0278  ammonium transporter  49.34 
 
 		 480 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0272  ammonium transporter  49.78 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  45.31 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  49.77 
 
 		 476 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  51.37 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  52.91 
 
 		 502 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  49.64 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0373  ammonium transporter  49.02 
 
 		 480 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  47.29 
 
 		 498 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  46.49 
 
 		 500 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2032  ammonium transporter  53.18 
 
 		 482 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.482356  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  46.05 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  51.82 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2734  ammonium transporter  47.85 
 
 		 509 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  51.24 
 
 		 445 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  51.46 
 
 		 503 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  51.7 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  51.46 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  47.25 
 
 		 498 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  49.88 
 
 		 445 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  47.25 
 
 		 498 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  49.76 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  49.4 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0694  ammonium transporter  50.73 
 
 		 452 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  48.45 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  48.93 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>