More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1101 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  100 
 
 		 432 aa  859    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  60.84 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  60.84 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  60.84 
 
 		 500 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  60.84 
 
 		 478 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  60.84 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  60.84 
 
 		 469 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  60.84 
 
 		 500 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  60.84 
 
 		 500 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  60.84 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  60.84 
 
 		 500 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  60.84 
 
 		 500 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  59.16 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  60.84 
 
 		 500 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  59.61 
 
 		 504 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  58.62 
 
 		 501 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  57.32 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  57.32 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  59.85 
 
 		 497 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  57.39 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  59.85 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  56.65 
 
 		 499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  53.21 
 
 		 444 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  53.28 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  52.38 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  52.06 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  53.1 
 
 		 459 aa  414  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  51.83 
 
 		 433 aa  408  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2331  ammonium transporter  52.59 
 
 		 446 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  53.78 
 
 		 438 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  51.1 
 
 		 443 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  50.5 
 
 		 439 aa  401  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  49.88 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  49.88 
 
 		 436 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  51.45 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  47.74 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  48.29 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  50.48 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  47.22 
 
 		 436 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  47.66 
 
 		 476 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  47.94 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  54.5 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  47.22 
 
 		 515 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  49.39 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  50.35 
 
 		 451 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  46.99 
 
 		 524 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  47.43 
 
 		 477 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  53.11 
 
 		 442 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  52.88 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  47.92 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  49.27 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  48.07 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  50 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  49.76 
 
 		 449 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  51.12 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  43.96 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  43.96 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  48.91 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  47.5 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  50.78 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  48.67 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  43.96 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  47.95 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  47.03 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  54.26 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  48.16 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  46.15 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  48.67 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  43.08 
 
 		 500 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  42.18 
 
 		 506 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  48.8 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  52.48 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  44.91 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  46.26 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  43.64 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  44.68 
 
 		 510 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  48.92 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0178  ammonium transporter  48.15 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  43.42 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  46.12 
 
 		 428 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0184  ammonium transporter  47.6 
 
 		 515 aa  365  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  48.34 
 
 		 472 aa  364  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  52.05 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0593  ammonium transporter  50.99 
 
 		 440 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  42.32 
 
 		 499 aa  363  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  45.54 
 
 		 504 aa  363  4e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  48.47 
 
 		 515 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  46.82 
 
 		 429 aa  362  6e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  46.43 
 
 		 430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  47.18 
 
 		 485 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  49.39 
 
 		 467 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  48.24 
 
 		 515 aa  360  3e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  46.93 
 
 		 488 aa  360  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  45.94 
 
 		 499 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  51.81 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  51.81 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  51.19 
 
 		 423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  46.38 
 
 		 466 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  46.43 
 
 		 489 aa  356  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  49.13 
 
 		 457 aa  356  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>